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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002425`

染色体: Chr03 坐标: 38538080-38542179 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002425`
名称	SmilChr03G002425
描述	phosphatidylinositol:ceramide inositolphosphotransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38538080 - 38542179 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016611`
GeneID	`131016611`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016611`
原始查询	`SmilChr03G002425`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol:ceramide inositolphosphotransferase 1-like
产物	phosphatidylinositol:ceramide inositolphosphotransferase 1-like
Arabidopsis	`AT3G54020` (AtIPCS1) Inositol phosphorylceramide synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824569] identity=74.4; qcov=1; evalue=2.05e-176; confidence=high
Rice	`Os05g0452900` - identity=67.5; qcov=1.05; evalue=1.95e-164; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0033188 (sphingomyelin synthase activity); GO:0045140 (inositol phosphoceramide synthase activity); GO:0046513 (ceramide biosynthetic process); GO:0047493 (ceramide cholinephosphotransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF14360 (PAP2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016611

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057801301.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057801301.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057801301.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801301.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801301.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38538336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:38538992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B1,B80
`Chr3:38539417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B127,B74,B99,C82
`Chr3:38540081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B22
`Chr3:38540199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:38540268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:38541582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801301.1

309 aa

154

309

PAP2_C

PF14360 PAP2_C 172-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801301.1`	Pfam	`PF14360`	PAP2_C	Domain	172	240	4.4e-21	75.9	PAP2 superfamily C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945318.1
CCAATTTGATAGTAAAGAATTCGAGTCCGTTGTTTTCTCTTGGCGAAAATCTGAATCTTAATAATCAATATAATTTCTAAAAGAAATAATTTGTCTTAATAGTATGCTACCAAATATATTTTGATATTTATAGATTATCGAGAATATTTTAGAATTTGAATTTATTAGTAATTCCAAGTTTGCCCTGATTCTCAACTGTTGTCCGTGTTCAACTCTCACCGGAGAGGCAAATCAGAAGAAGAATATTAGGAGAGAGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016611
ATGTCGCTTTACATTGGTCGCGAGGCTTCAAAGTTATGGAAGAGAATTTGTACAGAGACCTCAACAGAAATCGTTCTTCTTGGTGAAAATTGGAAGTATATTTTAGGTGGCCTCATATTTCAGTACATCCATGGACTGGCAGCTCGAGGAGTTCATTATTTACATAGGCCTGGTCCGACACTTCAAGATCTAGGCTTCTTTCTTCTTCCAGAGCTTGGGCAAGACAGAGCTTATATCAGTGAAACTGTATTTAGCATTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801301.1
MSLYIGREASKLWKRICTETSTEIVLLGENWKYILGGLIFQYIHGLAARGVHYLHRPGPTLQDLGFFLLPELGQDRAYISETVFSIIFLSFILWTFHPFFSKSKKIYTVLIWCRVLAFLVACQTLRIITFYSTQLPGPNYHCREGSKLARLPRPDNILEVLLINFPRGVLYGCGDLIFSSHMIFSLVFVRTFHKYGTHRFVKHCAWLTVVTQSLLIVASRKHYTVDVVVAWYTVNLVVFFLDKKLPELPDRSSGSASQLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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