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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002531`

染色体: Chr03 坐标: 40377126-40379578 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002531`
名称	SmilChr03G002531
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40377126 - 40379578 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016692`
GeneID	`131016692`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016692`
原始查询	`SmilChr03G002531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD6
产物	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD6
Arabidopsis	`AT3G53710` (AGD6) ARF-GAP domain 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824538] identity=62.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0278400` - identity=61.2; qcov=1; evalue=2.51e-173; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01412 (ArfGap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016692

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057801379.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057801379.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801379.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801379.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801379.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40377588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:40377652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:40377658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C4,C8,C82
`Chr3:40377797`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B64,C16,C23,C24,C56
`Chr3:40377797`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B64,C16,C23,C24,C56
`Chr3:40377873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B31
`Chr3:40378532`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C12
`Chr3:40378532`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C12
`Chr3:40378535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:40378588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B31
`Chr3:40378625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B122
`Chr3:40378920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801379.1

460 aa

230

460

ArfGap

PF01412 ArfGap 5-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801379.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	5	110	2.6e-34	118.5	Putative GTPase activating protein for Arf

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945396.1
AATATTTATATACTTTTTCATTTCTAACCCATCTCCTGTCAGTTGCCAGTGGCCGTAATCCATCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTATTTGGTCCGTTTGCATCAGCCATTTTTCCTTGAATTGCTTAGATCCGATTTCTCTCTCTCTCCCAGTCTCTTTCTCTATTGCGTGTTCTGGCATCAACAATCATCGATTGAATTCCGTAGATCCGCATCGCCAAACCCCACGCACCGACACCAATCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016692
ATGGCAGCGTCACGGCGGCTCCGGGAGCTCCAATCGCAATCCGGAAACAAGATCTGCGTCGATTGCTCCCAAAAGAACCCCCAATGGGCGTCGGTGTCGTACGGCATATTCATGTGCCTCGAGTGCTCCGGCAAGCACCGGGGCCTCGGCGTCCACATCTCCTTCGTCCGATCGGTCACCATGGATTCCTGGTCCGAGATCCAGCTCAAGAAGATGGAGCTCGGAGGCAACGAGAAGTTCAATAATTTTGTCTCGCAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801379.1
MAASRRLRELQSQSGNKICVDCSQKNPQWASVSYGIFMCLECSGKHRGLGVHISFVRSVTMDSWSEIQLKKMELGGNEKFNNFVSQYGVPKETDIVAKYNTKAAAVYRDRIQALAEGKPWRDPPVVKESLNSNKNSYSSKPPLSGRNGNSGGDAGWDSWDSFDDGANSNIRRNNTVGDFRSGGSGGNAPSRSKSTDNMYSRAELEASAANKGDFFARKISENQSRPEGLPPSQGGKYVGFGSSPSPAPMKNADGDVLSVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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