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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002579`

染色体: Chr03 坐标: 41006576-41010508 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002579`
名称	SmilChr03G002579
描述	protein SODIUM POTASSIUM ROOT DEFECTIVE 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41006576 - 41010508 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016736`
GeneID	`131016736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016736`
原始查询	`SmilChr03G002579`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SODIUM POTASSIUM ROOT DEFECTIVE 2-like
产物	protein SODIUM POTASSIUM ROOT DEFECTIVE 2-like
Arabidopsis	`AT2G37390` (NAKR2) Chloroplast-targeted copper chaperone protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818315] identity=39.5; qcov=1.15; evalue=3.13e-42; confidence=medium
Rice	`Os03g0819400` (OJ1754_E06.11) - identity=44.5; qcov=0.593; evalue=3.27e-31; confidence=medium
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801427.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801427.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801427.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801427.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801427.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41006909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B28,B46,D3
`Chr3:41006973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:41006991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C13,D6
`Chr3:41007122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B50,B59,B6,C58
`Chr3:41007126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:41007254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr3:41010100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr3:41010147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C13,D6
`Chr3:41010255`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	4	A11,B100,B80,C28
`Chr3:41010255`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A11,B100,B80,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801427.1

231 aa

116

231

HMA

PF00403 HMA 146-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801427.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	146	198	3.7e-13	50.4	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945444.1
CAGTTATTGGAATTTAAAGCATTATATAATTTCAGTCAATAATGCATGTTAGTTTCTATATTTAGTACTATAAATCAAACAAATTACAATATATATCCACACACTGAATACGAATTTCAATAAATATAATATAACTTGTTCAAAAAAAGGATGAAGTATATAATAGAAGATTCCGCAGTATTTATATTTTTGTTTTTGCAGCCCTTGCTCCCCTCGTTAGGTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTATCGTGAGCTCAGCTGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016736
ATGAAAGGCGTGGACATGTTCTGCTCATCAGAAGCGGCAACTTCAATATGCCTAAGCTCGACAGCATCTCCTTCCGCCACCACACTCCTCGGCGGCGGAAGAATCATCGACCGCCACAACCCAATCATCAAAGACTCCAAAAGAGCTCCCAAACCCACCCCACCCACCAAAAAGACAAAGAATTCAAACGAAACCAAAACCGACACCTCCTCTCTCTCTAAACTCGACGCCATAGCCATGGTGAAGAAGAGCTGGAGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801427.1
MKGVDMFCSSEAATSICLSSTASPSATTLLGGGRIIDRHNPIIKDSKRAPKPTPPTKKTKNSNETKTDTSSLSKLDAIAMVKKSWSCTNPGDFLSPPGSTRYLLREKVCDNTPPDSDPTNLCAQETSNKEDSTPSHSSHQVVVVVLRVSLHCRGCVKKLSKHLSRMEGIKSFDIDFLAKKVTVTGNVTPSDVLSSISKVKNAQLWPPSISSSNPTSQLNTLQNNIAATAQI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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