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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002650`

染色体: Chr03 坐标: 42165218-42170027 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002650`
名称	SmilChr03G002650
描述	phragmoplastin DRP1E-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	42165218 - 42170027 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015840`
GeneID	`131015840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015840`
原始查询	`SmilChr03G002650`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phragmoplastin DRP1E-like
产物	phragmoplastin DRP1E-like
Arabidopsis	`AT3G60190` (DL1E) DYNAMIN-like 1E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825189] identity=82.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0567800` (OsDRP1C) - identity=81.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00350 (Dynamin_N); PF01031 (Dynamin_M); PF02212 (GED)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800261.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800261.1`
3	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.60000	`XP_057800261.1`
4	Phragmoplast	Phragmoplast	0.60000	`XP_057800261.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.40000	`XP_057800261.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:42165641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:42166191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:42166216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:42167054`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr3:42167054`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr3:42167535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B17,D11
`Chr3:42167569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:42167709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:42168760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B77
`Chr3:42168831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B84,C84
`Chr3:42168844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C40
`Chr3:42169113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800261.1

623 aa

312

623

Dynamin_N

Dynamin_M

GED

PF00350 Dynamin_N 41-217 aa PF01031 Dynamin_M 225-493 aa PF02212 GED 528-619 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800261.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	41	217	7e-57	192.8	Dynamin family
`XP_057800261.1`	Pfam	`PF01031`	Dynamin_M	Family	225	493	1.1e-63	215.8	Dynamin central region
`XP_057800261.1`	Pfam	`PF02212`	GED	Family	528	619	4.2e-24	85.3	Dynamin GTPase effector domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944278.1
TATATTCAATAATGTATTTAATTTTGTTGATACACAAATTTTTGTGAGGGTAATAAAAATGAGTTAAACCAGAAGTAGACCGACGGTGCAATATATGACTAACCACACAGAATTTCAAATTATTTTTCCACTTCAAGTTGAAAAAATACCCCCAATTTCAACTTCTTCTCTCTTTCTCTCATTTCAACTCCATACACTTGTTGTTCCTCTACTGTCTTTCACTTCAATTCCTTTGGGCTTGCAAGGAGCTGAAGCTGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015840
ATGGCGACAATGGAAAGTTTGATTGGATTGGTGAACAGAATACAGAGGGCTTGCACCGCCCTCGGCGACTACGGCGGCGGCGACCAGGCCTTCTCCTCGCTCTGGGACGCTCTCCCCTCCGTTGCCGTTGTCGGTGGTCAGAGTTCAGGGAAGTCTTCGGTTTTGGAGAGCATAGTAGGACGTGATTTTCTTCCTCGAGGCTCTGGAATTGTTACGAGGAGACCGCTGGTGTTGCAACTGCAGAAAACGGAAGATGGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800261.1
MATMESLIGLVNRIQRACTALGDYGGGDQAFSSLWDALPSVAVVGGQSSGKSSVLESIVGRDFLPRGSGIVTRRPLVLQLQKTEDGQQEYAEFGHLPRRKFSDFGLVRKEIQDETDRITGKTKQISPVPIHLSIYSPNVVNLTLIDLPGLTKVAVEGQPETIVEDIENMVRAYVEKPNCIILAISPANQDIATSDAIKLAREVDPSGERTFGVLTKLDLMDKGTNAIDVLDGRAYRLQHPWVGIVNRSQADINKNVDMMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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