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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002881`

染色体: Chr03 坐标: 45487847-45490294 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002881`
名称	SmilChr03G002881
描述	uncharacterized SmilChr03G002881
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45487847 - 45490294 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018874`
GeneID	`131018874`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018874`
原始查询	`SmilChr03G002881`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG01250` - identity=60.7; qcov=0.085; evalue=1.49e-18; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=31.6; qcov=0.779; evalue=2.65e-65; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018874

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803553.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057803553.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803553.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803553.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45487851`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B118,B28
`Chr3:45487851`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B118,B28
`Chr3:45487875`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	175	A1,A10,A13,A14,A16,A19,A21,A22,A24,A25,A6,B1,B10,B101,B103,B104,B106,B107,B108,B110,B111,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B129,B130,B131,B133,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B29,B3,B30,B32,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B49,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B73,B75,B77,B78,B79,B80,B83,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C15,C17,C19,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C59,C61,C62,C65,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C8,C81,C82,C83,C85,C86,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:45487878`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	104	A1,A10,A18,A19,A25,A6,A8,B10,B100,B103,B107,B108,B109,B110,B113,B115,B117,B118,B119,B124,B132,B133,B136,B18,B2,B21,B24,B25,B26,B27,B29,B33,B35,B39,B42,B44,B45,B49,B5,B50,B51,B55,B56,B6,B60,B63,B66,B68,B69,B7,B74,B75,B78,B79,B8,B80,B84,B85,B87,B88,B92,B93,B95,B97,B98,B99,C1,C17,C18,C2,C23,C27,C28,C31,C33,C34,C4,C40,C41,C42,C45,C46,C50,C52,C53,C58,C60,C61,C63,C65,C67,C70,C71,C72,C74,C76,C82,C86,C87,D10,D11,D4,D8,D9
`Chr3:45487908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:45487949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:45487958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,D2
`Chr3:45487981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr3:45487989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C1
`Chr3:45488001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B33,B79,C36
`Chr3:45488008`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A18,A8,B110,B111,B120,B126,B127,B129,B132,B17,B18,B24,B30,B35,B50,B54,B6,B69,B70,B93,B99,C1,C16,C41,C46,C50,C58,C67,C71,C76,C77,D4,D6,D8,D9
`Chr3:45488009`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	177	A11,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A21,A22,A24,A25,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B128,B13,B130,B131,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B15,B16,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B42,B43,B46,B48,B49,B5,B51,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B64,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B76,B77,B79,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B97,B98,B99,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C34,C35,C36,C39,C40,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C62,C63,C65,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C77,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803553.1

662 aa

331

662

RVT_1

PF00078 RVT_1 324-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803553.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	324	524	1.5e-21	77.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947570.1
ATGACGGTGCAATCATCGTCGCTTCACCATATTTTGGTTTCCGTTAATGATGGTATTCATCCATCTTGGGATTTTTGTGGTTTGTATGGGTGGAGTCGAACTGAAGAACATGTTTTGACTTGGGATCTCATGCGTTCTTTTACTCCATATGTTCAAGAGAGCTGGATATGTGCTGGAGATTTCAACGAAACTATGTTCCACTTTGAGAAGAGGAGAGGAAACTTGAAAGCGGATGAGAGATTAATGGATTTTAGAGAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018874
ATGACGGTGCAATCATCGTCGCTTCACCATATTTTGGTTTCCGTTAATGATGGTATTCATCCATCTTGGGATTTTTGTGGTTTGTATGGGTGGAGTCGAACTGAAGAACATGTTTTGACTTGGGATCTCATGCGTTCTTTTACTCCATATGTTCAAGAGAGCTGGATATGTGCTGGAGATTTCAACGAAACTATGTTCCACTTTGAGAAGAGGAGAGGAAACTTGAAAGCGGATGAGAGATTAATGGATTTTAGAGAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803553.1
MTVQSSSLHHILVSVNDGIHPSWDFCGLYGWSRTEEHVLTWDLMRSFTPYVQESWICAGDFNETMFHFEKRRGNLKADERLMDFRETVDLCGLSDLSFMGDPFTWSNNQQGVDNIMERLDRALGSATWAAMFPGYEVSHLLRKSSDHCPILLNLDKDLREIQNRPKPFHFEAMWLKDDRCLPFCANLWNSAEGRKKRNYIREIQKADGTTVRANDELDEVFWSHFQTLFTSGSTHNPAEVLQSIEPVVTTEMNRNLTAPY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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