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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003183`

染色体: Chr03 坐标: 49286836-49291900 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003183`
名称	SmilChr03G003183
描述	protein TIFY 4B-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49286836 - 49291900 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016321`
GeneID	`131016321`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016321`
原始查询	`SmilChr03G003183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIFY 4B-like
产物	protein TIFY 4B-like
Arabidopsis	`AT4G14720` (AT4G14720) TIFY domain/Divergent CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827125] identity=43; qcov=1.01; evalue=2.49e-53; confidence=medium
Rice	`Os03g0402800` (OsJAZ5) - identity=31.1; qcov=0.538; evalue=1.12e-09; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009611 (response to wounding); GO:0031347 (regulation of defense response); GO:2000022 (regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF06200 (tify); PF09425 (Jas_motif)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016321

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800987.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800987.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800987.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800987.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800987.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49287471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:49291007`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	90	A10,A15,A18,A19,A20,A24,A25,A4,A8,B1,B100,B107,B109,B112,B114,B115,B124,B125,B126,B131,B132,B133,B135,B137,B139,B140,B15,B21,B23,B24,B26,B31,B32,B33,B37,B41,B43,B44,B46,B48,B50,B51,B53,B56,B58,B66,B67,B7,B71,B72,B77,B79,B8,B82,B88,B90,B94,B97,C11,C14,C15,C20,C22,C25,C27,C3,C30,C31,C32,C39,C4,C42,C46,C49,C50,C52,C61,C62,C68,C71,C73,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C9,D3,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800987.1

395 aa

198

395

tify

Jas_motif

PF06200 tify 160-188 aa PF09425 Jas_motif 258-279 aa

XP_057800988.1

343 aa

172

343

tify

Jas_motif

PF06200 tify 160-188 aa PF09425 Jas_motif 258-279 aa

XP_057800989.1

275 aa

138

275

tify

Jas_motif

PF06200 tify 160-188 aa PF09425 Jas_motif 258-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800987.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	160	188	6.6e-15	54.8	tify domain
`XP_057800987.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	258	279	9.2e-06	26.0	Jas motif
`XP_057800988.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	160	188	6.1e-15	55.0	tify domain
`XP_057800988.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	258	279	7.7e-06	26.3	Jas motif
`XP_057800989.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	160	188	4.5e-15	55.4	tify domain
`XP_057800989.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	258	275	6.7e-05	23.3	Jas motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945005.1
ACCGCTTACGTGGCACTCTGGGGATGCACCTCCGTCGCCCCCCACCCCCGCAAAACCCAAAAAGAAATAGAAGAAAAGTAAAAAAGGAAATTCCGCACTAGACAAAGCTGCGACGCCGCGGCCATATTTCCCGCAACCACCAGTCCACCACACTCTCCCTCACTCACTCGCTCAGCCACAACCTCGAATTACCAAAATAGCCCCCAATTCCGCCCGAATTCCCCACCCTACCGCTCGATCTGCTACCTCGCTTTCGCCGG...

XM_057945006.1
GGATGCACCTCCGTCGCCCCCCACCCCCGCAAAACCCAAAAAGAAATAGAAGAAAAGTAAAAAAGGAAATTCCGCACTAGACAAAGCTGCGACGCCGCGGCCATATTTCCCGCAACCACCAGTCCACCACACTCTCCCTCACTCACTCGCTCAGCCACAACCTCGAATTACCAAAATAGCCCCCAATTCCGCCCGAATTCCCCACCCTACCGCTCGATCTGCTACCTCGCTTTCGCCGGAGAGCTAATCGTACAGTTCAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016321
ATGCCGGAATCTTGCGCCGCCCCGCCGGAGGAGACCGCAGTTAAGTCCCCGCTCGACAAGCCGCTCCACCAGCTCACGGAGGATGACATTGCTCAGGTGACTCGCGAAGACTGCCGCCGTTACCTCAAGGAGAAAGGAATGAGGAGACCTTCGTGGAACAAATCTCAGGCGATTCAGCAAGTGATAATGCTGAAGACACTCCTCGAAACAACGCCGGATTCGGACGCTGCTGGTGCGCGCAAGCGGCTTCGCATTTCGCG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057800987.1
MPESCAAPPEETAVKSPLDKPLHQLTEDDIAQVTREDCRRYLKEKGMRRPSWNKSQAIQQVIMLKTLLETTPDSDAAGARKRLRISRPTDSSSNVALESVPRSTTGDAENSLSAEETTPHSVKDLDKPDSSGGFSSRFAAANDESAQPRTPGSMNMPIGQMTIFYCGKVNVYDDIPADKVRALMHIAASPLQFPDEQPVDGAAGMQPLPCIPKTVSSARQDSAVLILPTLPTVKMNESTPLPGEENKMLREETPVEGPST...

XP_057800988.1
MPESCAAPPEETAVKSPLDKPLHQLTEDDIAQVTREDCRRYLKEKGMRRPSWNKSQAIQQVIMLKTLLETTPDSDAAGARKRLRISRPTDSSSNVALESVPRSTTGDAENSLSAEETTPHSVKDLDKPDSSGGFSSRFAAANDESAQPRTPGSMNMPIGQMTIFYCGKVNVYDDIPADKVRALMHIAASPLQFPDEQPVDGAAGMQPLPCIPKTVSSARQDSAVLILPTLPTVKMNESTPLPGEENKMLREETPVEGPST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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