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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003318`

染色体: Chr03 坐标: 51414322-51422102 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003318`
名称	SmilChr03G003318
描述	autophagy-related protein 9
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51414322 - 51422102 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014212`
GeneID	`131014212`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014212`
原始查询	`SmilChr03G003318`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 9
产物	autophagy-related protein 9
Arabidopsis	`AT2G31260` (APG9) autophagy 9 (APG9) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817683] identity=63.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0248000` (OsATG9a) - identity=51.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000407 (phagophore assembly site); GO:0000422 (autophagy of mitochondrion); GO:0005776 (autophagosome); GO:0034497 (protein localization to phagophore assembly site); GO:0044805 (GO:0044805)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04109 (ATG9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014212

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057798086.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057798086.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057798086.1`
4	Endosome	内体	0.60000	`XP_057798086.1`
5	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.40000	`XP_057798086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51417451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B59,B68,B79,B95
`Chr3:51417521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr3:51417717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B100,B19
`Chr3:51417718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B31,B90,B92,C59
`Chr3:51418171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B68,B79,B95
`Chr3:51419645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B107,B35
`Chr3:51420514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr3:51420526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:51420861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,D11
`Chr3:51421356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:51421510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:51421572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798086.1

876 aa

438

876

ATG9

PF04109 ATG9 64-557 aa

XP_057798087.1

876 aa

438

876

ATG9

PF04109 ATG9 64-557 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798086.1`	Pfam	`PF04109`	ATG9	Family	64	557	3.7e-160	534.7	Autophagy protein ATG9
`XP_057798087.1`	Pfam	`PF04109`	ATG9	Family	64	557	3.7e-160	534.7	Autophagy protein ATG9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942104.1
CACGTCTCCTTTTCTCCATCGGAAAAAGAAAAATGAAAAAATAAAAATAACGTTTTTATATATAGGGAGAGAAAACACAAGATAAGCAGCATACAATAAGCGGAATCCACTTCGAAAAACTTGGAACAAATAATCAAAATTTGTTGAAAGATTTTATACGCCGCTTCACGCAATCACAACCCTCCTTCTCCAATCGGTGCCTCCACCGCGCTCCTACCAAATTAGGGGGGGAAATAAAAATAATAAATTTGAACTTCTTC...

XM_057942103.1
CACGTCTCCTTTTCTCCATCGGAAAAAGAAAAATGAAAAAATAAAAATAACGTTTTTATATATAGGGAGAGAAAACACAAGATAAGCAGCATACAATAAGCGGAATCCACTTCGAAAAACTTGGAACAAATAATCAAAATTTGTTGAAAGATTTTATACGCCGCTTCACGCAATCACAACCCTCCTTCTCCAATCGGTGCCTCCACCGCGCTCCTACCAAATTAGGGGGGGAAATAAAAATAATGTTTTTGTTTACTTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131014212
ATGTTCAGTGGGCAAAAAGGATTTCATGCTCTCAATATATTCAAGTGGAGACAGGGTAGTACATCGTCTCTGACTACTGGGTTGCTTAATGATGTGCCGCATGAAATTGAGTTATCTGATTATCATAGAGCACCGAGCCCTGGTAGTGAGAGCCCATCCGGGCTTCTTGATGGAGAGACCTTGGATACTGAGCCGATTGATGATTTGGATCTGTTCTTTGAGAGGATTTACACCTATTACTGCGAGAAAGGCCTCTGGTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057798086.1
MFSGQKGFHALNIFKWRQGSTSSLTTGLLNDVPHEIELSDYHRAPSPGSESPSGLLDGETLDTEPIDDLDLFFERIYTYYCEKGLWCIIIKWMFELLSLAFTICFSGFFLLFVDWNGLRNAKCGMDAVESGIRPCDLSEEALHKHPLTPFTLSKAIIVGYLGIFSIYCIFCFLRFFAQLKETLKIRWFYYNSLHVTDNEIQTMPWSLILEKVVQVQQTQQLCVVKDLSMHDVVMRLMRKENYLIGMLNKRVLAFPISQWV...

XP_057798087.1
MFSGQKGFHALNIFKWRQGSTSSLTTGLLNDVPHEIELSDYHRAPSPGSESPSGLLDGETLDTEPIDDLDLFFERIYTYYCEKGLWCIIIKWMFELLSLAFTICFSGFFLLFVDWNGLRNAKCGMDAVESGIRPCDLSEEALHKHPLTPFTLSKAIIVGYLGIFSIYCIFCFLRFFAQLKETLKIRWFYYNSLHVTDNEIQTMPWSLILEKVVQVQQTQQLCVVKDLSMHDVVMRLMRKENYLIGMLNKRVLAFPISQWV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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