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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003354`

染色体: Chr03 坐标: 51862361-51863961 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003354`
名称	SmilChr03G003354
描述	60S ribosomal protein L14-2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	51862361 - 51863961 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014250`
GeneID	`131014250`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014250`
原始查询	`SmilChr03G003354`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L14-2
产物	60S ribosomal protein L14-2
Arabidopsis	`AT4G27090` (AT4G27090) Ribosomal protein L14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828817] identity=87.3; qcov=1; evalue=8.06e-81; confidence=high
Rice	`Os04g0515300` - identity=83.6; qcov=1; evalue=1.84e-80; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01929 (Ribosomal_L14e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014250

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798141.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057798141.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057798141.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798141.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:51862538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C13
`Chr3:51862872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C77,D6
`Chr3:51862895`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr3:51862895`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr3:51862903`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A1,A7,B16,B18,B3,B86,C11,C16,C3,C69,C80
`Chr3:51862909`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A1,A7,B16,B18,B3,B86,C11,C16,C3,C69,C74,C80
`Chr3:51862911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr3:51863051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798141.1

134 aa

134

Ribosomal_L14e

PF01929 Ribosomal_L14e 45-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798141.1`	Pfam	`PF01929`	Ribosomal_L14e	Family	45	117	1e-26	94.0	Ribosomal protein L14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942158.1
CCTTTGTTGTATCGACTAACTGTTACTGGACCTCATAGTTGTATTAATGGGCCGAGCTTCAACATTACCGCCCAAAATTCTAAAGCCCAATTAGCGCTCGGAAAAACCCTAACCCTAATCTCCCTTCACAAAACCTTCACTTTCAACCCTACCTCTCTCACTCTACACCCCGCAGACGGACGCACCACCAGATCCCCGCTCATCATGCCGTTCAAGAGGTACGTGGAGATCGGAAGGGTAGCCCTCGTTAATTATGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014250
ATGCCGTTCAAGAGGTACGTGGAGATCGGAAGGGTAGCCCTCGTTAATTATGGCGAGGACTATGGCAAGCTTGTCGTCATTGTAGATGTCATCGATCAGAACCGGGCCCTTGTCGATTCCCCTGATATGGTACGTAGTCAGATGAACTTCAAGAGACTTTCTCTTACAGACATCAAGATTGACATCAAAAGAGTTCCAAAGAAGAAAGCTCTTGTTGCTGCTATGGAGGCTGCTGATGTCAAAGGCAAATGGGAAAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798141.1
MPFKRYVEIGRVALVNYGEDYGKLVVIVDVIDQNRALVDSPDMVRSQMNFKRLSLTDIKIDIKRVPKKKALVAAMEAADVKGKWEKSSWGRKLIVQKRRASLNDFDRFKLMLAKIKKAGVVRQELAKLKKETAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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