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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003480`

染色体: Chr03 坐标: 53348809-53359732 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003480`
名称	SmilChr03G003480
描述	peptide-N(4)-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53348809 - 53359732 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014368`
GeneID	`131014368`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014368`
原始查询	`SmilChr03G003480`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide-N(4)-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase
产物	peptide-N(4)-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase
Arabidopsis	`AT5G49570` (PNG1) peptide-N-glycanase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835019] identity=63.1; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0497400` (PNG1) - identity=61.8; qcov=0.591; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0000224 (peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006515 (protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins); GO:0006516 (glycoprotein catabolic process); GO:0006517 (protein deglycosylation)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01841 (Transglut_core); PF03835 (Rad4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014368

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798309.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798309.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057798309.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798309.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798309.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53351702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C28,C74
`Chr3:53356498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C58,C71,C85
`Chr3:53356615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:53357170`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B6,C34
`Chr3:53357170`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B6,C34
`Chr3:53357200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C22
`Chr3:53358585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:53359402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C37
`Chr3:53359418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798309.1

726 aa

363

726

Transglut_core

Rad4

PF01841 Transglut_core 219-300 aa PF03835 Rad4 282-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798309.1`	Pfam	`PF01841`	Transglut_core	Domain	219	300	4.4e-18	66.3	Transglutaminase-like superfamily
`XP_057798309.1`	Pfam	`PF03835`	Rad4	Domain	282	389	1.2e-10	41.9	Rad4 transglutaminase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942326.1
ACTTGAAATGCACTCGAGACTCGAGAGGGGCTGAGTTTTCCATCTCAGTTGACTCCTGGAAATTTGGTGATCCTTGCACGCACATTTACAGTTTTCCGACACAAGAAAAGAATCACTGAAGAATGGTGGCCCGCAAATTCGTGGTTGAACACGGCGCCTCCTCCTTCGACGTCGACTACGACACTAACGATGGCTTCGAAGTGCTCAAGTTCCAGCTTTTCTCTCTCACCTCCATCCCTCCTGATCATCAAAAGCTATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014368
ATGGTGGCCCGCAAATTCGTGGTTGAACACGGCGCCTCCTCCTTCGACGTCGACTACGACACTAACGATGGCTTCGAAGTGCTCAAGTTCCAGCTTTTCTCTCTCACCTCCATCCCTCCTGATCATCAAAAGCTATTGGGAGGTGATGGCACAACTGTGGTGTCGGATGATTCTGATCTTGGATTGATTTCTGATAAGTTGCGGTTGATCTCAATTGGTGAGGATGATAACTCAGAGCAAGTGGAAACATCTGTACCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798309.1
MVARKFVVEHGASSFDVDYDTNDGFEVLKFQLFSLTSIPPDHQKLLGGDGTTVVSDDSDLGLISDKLRLISIGEDDNSEQVETSVPDLISSDEEFARLLQAEEEALMMQQFVTSENREQVEQRIRPYIDQVLMYENPQRQEAARKTVPVDKLEEKAVVALAREGNFKPTKDELDHAFLLQLLFWFKQSFRWVNSPPCDSCNSETINQGMGIPTHSESHYGASRVELYRCKSCSSITRFPRYNDPMKLLETRKGRCGEWAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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