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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003486`

染色体: Chr03 坐标: 53431695-53448506 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003486`
名称	SmilChr03G003486
描述	sec-independent protein translocase protein TATA, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	53431695 - 53448506 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014376`
GeneID	`131014376`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014376`
原始查询	`SmilChr03G003486`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sec-independent protein translocase protein TATA, chloroplastic
产物	sec-independent protein translocase protein TATA%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G28750` (AT5G28750) Bacterial sec-independent translocation protein mttA/Hcf106 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832987] identity=54.8; qcov=0.759; evalue=8.08e-30; confidence=medium
Rice	`Os03g0634000` (TATA) - identity=65.8; qcov=0.599; evalue=5.06e-32; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0043953 (protein transport by the Tat complex)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02416 (TatA_B_E)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014376

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057798318.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057798318.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057798318.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798318.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798318.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:53431887`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C39
`Chr3:53431887`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C39
`Chr3:53434052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr3:53434081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B87,B96,C31,C72,C80
`Chr3:53434082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B9,C22,C25,D4
`Chr3:53434155`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B104,C16,C29,C44,C52,C58
`Chr3:53434158`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B104,C16,C29,C44,C52,C58
`Chr3:53434165`	`GAT`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A21,B101,B67,C38,C80
`Chr3:53434303`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B98
`Chr3:53434303`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798318.1

137 aa

137

TatA_B_E

PF02416 TatA_B_E 63-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798318.1`	Pfam	`PF02416`	TatA_B_E	Family	63	110	1.4e-16	60.5	mttA/Hcf106 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942335.1
AACTTAATTTATTGTGTGTTTTCTTTTCTCCGAAGAAAAGGGGAAGTTCATCATAATTCATAATCATCCGACAAGTTTTACAAACAAACGATAATTGAGGTTAGTTGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGGAAACGTTGTTGTTTGACTGTTAGTTAGTCTTTAAGATACATAGCAATAGCCATTCCCTTTCCCAACGCATACAGCGACACACAAAACACGAGCCAAATCAGCTAAAAATCTCTCCTCCAATGGCCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014376
ATGGCCGCCGCCTCGTCTTCCACCGTAGCACTGCCACTCACCTCAAATCCATCGCTAAAACTCACTTCTCTCTCGTCCTCCACCTCAGTATTCTTCAGCTACAATATCAAGAACCGGGCCGGGCTCGGGCTCGCTCTGGATCGCCCCACCAGAGCTCAGAAACGGGGATTCTCCTGTAACTGCCTATTCGGGCTTGGAGTGCCGGAGCTCGTCGTGATTGTGGGCGTGTCGGCGCTCGTTTTCGGCCCCAAACAGCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798318.1
MAAASSSTVALPLTSNPSLKLTSLSSSTSVFFSYNIKNRAGLGLALDRPTRAQKRGFSCNCLFGLGVPELVVIVGVSALVFGPKQLPEVGRSIGKTVKSFQQAAKEFETELRKDVEASAEASDEKIETVEEGQQQEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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