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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003701`

染色体: Chr03 坐标: 55940824-55953645 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003701`
名称	SmilChr03G003701
描述	mitogen-activated protein kinase kinase 6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	55940824 - 55953645 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014567`
GeneID	`131014567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014567`
原始查询	`SmilChr03G003701`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase 6
产物	mitogen-activated protein kinase kinase 6
Arabidopsis	`AT5G56580` (MKK6) MAP kinase kinase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835759] identity=83.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0510100` (OsMKK6) - identity=76; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04620 (Toll-like receptor signaling pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057798560.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057798560.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057798560.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798560.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798560.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:55952264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B35,C23
`Chr3:55952392`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr3:55952392`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr3:55952397`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr3:55952397`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr3:55952403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:55952701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B76,C28,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798560.1

354 aa

177

354

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 70-324 aa PF00069 Pkinase 70-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798560.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	70	324	1.6e-39	136.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057798560.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	70	329	5.6e-69	233.2	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942577.1
TCGTTTTGTATAGTGAAGGACTGAAAGTCAAGACAAAAAGCAGCGGAATGCGGCCTTTGGACATTTAGAGTACCGTTGGAGGTGGGCGCTCATTCCCATTTGAATTTATCTTCTACTTCTCTCATTCTCGCTCACTGCGTAGCCCTAACTTTCTCTTGCTCAATCGAAATCATGAAGTTGAAGAAACCTCTCAAGGAGCTCAAGCTCTCTGTCCCAGCTCAGAATTCCCCAATCTCTTCATTTTTGACGGCGAGCGGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014567
ATGAAGTTGAAGAAACCTCTCAAGGAGCTCAAGCTCTCTGTCCCAGCTCAGAATTCCCCAATCTCTTCATTTTTGACGGCGAGCGGGACCTTTCACGATGGCGATTTATTGTTGAATCAAAAAGGGCTTCGATTGATTTCTGATGTGAATGAACCCCGCCCATCAGAGATTAAGGAGCTTGATCTTCAATTCTCACTGGAAGACCTTGAGACCATCAAAGTCATAGGCAAGGGAAGTGGTGGTGTTGTTCAACTTGTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798560.1
MKLKKPLKELKLSVPAQNSPISSFLTASGTFHDGDLLLNQKGLRLISDVNEPRPSEIKELDLQFSLEDLETIKVIGKGSGGVVQLVRHKWVGTFFALKVIQMTIQEEIRKQIVQELKINQASQCPNVVVCYHSFYHNGAISIVFEYMDRGSLVDVIRQVKTILEPYLAVLCKQVLQGLVYLHHEKHVIHRDIKPSNLLVNHKGEVKITDFGVSAMLASSMGQRDTFVGTYNYMAPERISGSTYDYKSDIWSLGMVILECA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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