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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004038`

染色体: Chr03 坐标: 59383426-59387129 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004038`
名称	SmilChr03G004038
描述	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59383426 - 59387129 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014932`
GeneID	`131014932`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014932`
原始查询	`SmilChr03G004038`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase 2-like
产物	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase 2-like
Arabidopsis	`AT2G39290` (PGP1) phosphatidylglycerolphosphate synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818514] identity=74.1; qcov=0.606; evalue=1.24e-97; confidence=high
Rice	`Os03g0283600` - identity=73.5; qcov=0.603; evalue=5.01e-100; confidence=high
GO	GO:0008444 (CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase activity); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0016020 (membrane); GO:0046474 (glycerophospholipid biosynthetic process)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01066 (CDP-OH_P_transf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014932

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799095.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057799095.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799095.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799095.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59383995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:59384270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C48,D11
`Chr3:59384411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:59385953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C23,C42
`Chr3:59386638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:59386658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr3:59386912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C48,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799095.1

325 aa

162

325

CDP-OH_P_transf

PF01066 CDP-OH_P_transf 131-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799095.1`	Pfam	`PF01066`	CDP-OH_P_transf	Family	131	306	2.6e-29	103.3	CDP-alcohol phosphatidyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943112.1
ATACGTGTAGGAGAAAAATTAGGTCATTATCGCACACGCAAAATCGATCGTAAAGATTTGCGAAATCCCCATCCTCACCACTGCTAACATAAGCCGCCCTGCTAACTTGAGCCTCCCTACACAATTTAACTCCGCACCACCAGTATGCCTGGCGCTCTTAAATTCACCAATTCTGTTATCCTACACCCCCACCAACCCTATACATTTCTCGTCCCCTCCTCCTCCGCCACCACCACCGGCCAATCGACGGCAACTATCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014932
ATGCCTGGCGCTCTTAAATTCACCAATTCTGTTATCCTACACCCCCACCAACCCTATACATTTCTCGTCCCCTCCTCCTCCGCCACCACCACCGGCCAATCGACGGCAACTATCCGGCTAAATCACTCCGTCGGCTGGTGGCGCAGGAAAACCGCATTCTCGCCTCCGGCGCACCGTAGAATCGCTTCGCGGAGCGGCCGGGAACATCTCCTATTCTCATCGGATTCTCAAAACGGAGAAGTAGATAGAAAGTTGTTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799095.1
MPGALKFTNSVILHPHQPYTFLVPSSSATTTGQSTATIRLNHSVGWWRRKTAFSPPAHRRIASRSGREHLLFSSDSQNGEVDRKLFCNSNTNFGSKMCATVDGKAESQSDVSSPTQKLTGKPPAQPAKLLTLPTILTIGRVAAVPLLVGTFYVESWWGPAVTTGIFIAAAFTDWLDGYLARKMDLGTPFGAFLDPVADKLMVAATLILLCTRPFEAGGLGHAPWLLTIPAIAIIGREITMSAVREWAAAQDRELLEAVAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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