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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004069`

染色体: Chr03 坐标: 59662715-59670497 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004069`
名称	SmilChr03G004069
描述	AP-4 complex subunit epsilon
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59662715 - 59670497 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014875`
GeneID	`131014875`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014875`
原始查询	`SmilChr03G004069`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-4 complex subunit epsilon
产物	AP-4 complex subunit epsilon
Arabidopsis	`AT1G31730` (AT1G31730) Adaptin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840060] identity=69.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0916200` - identity=66.5; qcov=0.906; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006898 (receptor-mediated endocytosis); GO:0030117 (membrane coat); GO:0030124 (AP-4 adaptor complex); GO:0140312 (cargo adaptor activity)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01602 (Adaptin_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014875

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057798993.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057798993.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.80000	`XP_057798993.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057798993.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.60000	`XP_057798993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59663280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr3:59663498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B58,C39,C56,D1
`Chr3:59663741`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A6,B1,B19,B28,B5,B55,B7,B91,C13,C15,C29,C71,C80
`Chr3:59663805`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A18,A4,B104,B109,B125,B13,B130,B133,B135,B137,B139,B19,B23,B29,B34,B37,B4,B47,B49,B54,B62,B68,B77,B79,B83,B86,B89,C1,C14,C19,C34,C38,C41,C43,C45,C51,C82,D2
`Chr3:59663807`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	38	A18,A4,B104,B109,B125,B13,B130,B133,B135,B137,B139,B19,B23,B29,B34,B37,B4,B47,B49,B54,B62,B68,B77,B79,B83,B86,B89,C1,C14,C19,C34,C38,C41,C43,C45,C51,C82,D2
`Chr3:59663811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B61,B81,C31,D8
`Chr3:59663916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B61,B81,C31,D8
`Chr3:59663974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:59665608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:59666841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:59669747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,D2
`Chr3:59670059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798993.1

950 aa

475

950

Adaptin_N

PF01602 Adaptin_N 43-582 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798993.1`	Pfam	`PF01602`	Adaptin_N	Repeat	43	582	3.7e-83	280.6	Adaptin N terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943010.1
ACTTCGCAGCAATGATTGTACATCAACGAGCCCCCCCTCTTTTATGATCTCTCCTTCTCCGCATTCCTTCTCTCCTTACACGTACACACAAAAACAAAAATACACACACATCTCAATTTCACACACTAATATATTGTCTCTCTCTGGATCTTCACCTCCTCTCTGCAGATTTCCCCAATTTCCCGAACCCTAAACCCAAATCTACTCCCAATTTCTTTCCCCGGGCCCGAATTTCATCCAATCTCGACCGAGATCGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014875
ATGGGCTCCCAAGGTGGATTCGGGCAGTCTAAGGAGTTCCTCGACCTCATCAAATCAATCGGCGAGTCTCGATCCAAAGCCGAGGAAGACCGCATTGTATTGCGTGAAGTGGAGACCCTCAAAGTTAGGTTGAACGACCCGAACACCCCCAAATACAAGCTCAAGGAGTACATAATCCGCCTCCTCTATGTCGAGATGCTCGGCCACGACGCCTCCTTCGGGTACATCCACGCCGTCAAGATGACGCACGACGAGAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798993.1
MGSQGGFGQSKEFLDLIKSIGESRSKAEEDRIVLREVETLKVRLNDPNTPKYKLKEYIIRLLYVEMLGHDASFGYIHAVKMTHDENLLLKRTGYLAVTLFLNEDHDLIILIVNTIQKDLKSDNFLVVCAALNAVCRLINEETIPAVLPQVVELLGHQKEAVRKKAVMALHRFSQKAPGSVSHLISNFRKKLCDNDPGVMGAALCPLFDLITADVDKYKDLVVSFVNILKQVAERRLPKSYDYHQMPAPFIQIKLLKILSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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