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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004084`

染色体: Chr03 坐标: 59753209-59759020 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004084`
名称	SmilChr03G004084
描述	beta-amylase 8
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59753209 - 59759020 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014889`
GeneID	`131014889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014889`
原始查询	`SmilChr03G004084`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-amylase 8
产物	beta-amylase 8
Arabidopsis	`AT5G45300` (BMY2) beta-amylase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834566] identity=60.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0569200` - identity=57.6; qcov=0.631; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000272 (polysaccharide catabolic process); GO:0016161 (beta-amylase activity)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01373 (Glyco_hydro_14); PF05687 (BES1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799016.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799016.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799016.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799016.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799016.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59753590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C82
`Chr3:59753633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B53,B74,C42,C60
`Chr3:59753648`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C31
`Chr3:59753648`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C31
`Chr3:59753734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:59753759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:59753923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:59753926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:59754007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:59754070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:59754073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:59754083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799016.1

688 aa

344

688

BES1_N

Glyco_hydro_14

PF05687 BES1_N 63-233 aa PF01373 Glyco_hydro_14 265-646 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799016.1`	Pfam	`PF05687`	BES1_N	Family	63	233	3.6e-46	158.0	BES1/BZR1 plant transcription factor, N-terminal
`XP_057799016.1`	Pfam	`PF01373`	Glyco_hydro_14	Domain	265	646	2.5e-95	320.7	Glycosyl hydrolase family 14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943033.1
TAATACTTTGTGGAGGATGTGAAATGCAAATTATGATAAACGACCAAGGAAGATGTTTGTCTGCGTGTGCGACAGTGTGAGAGGTGAGAGAGAGAGGGATTGAGAGAGGAGTGAGAGATGCAGCAACAATGAACACCAACGCCAACACAATGAACCACTGTTTCGCCGCGGCGGCACAGGATCTTGATCCACAACCGCCGCCGCCGCCGGCCACCAGCACCTCCACCCAACCGTACCACACGCAACCCCAGCCCCAGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014889
ATGAACACCAACGCCAACACAATGAACCACTGTTTCGCCGCGGCGGCACAGGATCTTGATCCACAACCGCCGCCGCCGCCGGCCACCAGCACCTCCACCCAACCGTACCACACGCAACCCCAGCCCCAGCGCCGCCTTCGCGGCTTTGCCGCCACAAACTCCAACAGCACCGCAACCGCTCCGATAAAAAGCAGGAAAGAGAGAGATAAGGAGAAGGAGCGGACGAAGCTTCGAGAGCGTCACCGTAGAGCCATCACCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799016.1
MNTNANTMNHCFAAAAQDLDPQPPPPPATSTSTQPYHTQPQPQRRLRGFAATNSNSTATAPIKSRKERDKEKERTKLRERHRRAITSRMLAGLRQYGNFPLPARADMNDVIAALAREAGWTVEPDGTTYRQTRPAPSMQPQSQPPPISHFNSIQQNNSNASNVGVNPVRSVESPLYSGALRNCSVRSSVDCQPSTLRVDENLSPTSLDSVVAERDAKLDKYSSASAIDSLECLKAGQLVQDVHCREHGNGLPETSYIPVY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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