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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004092`

染色体: Chr03 坐标: 59803780-59806458 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004092`
名称	SmilChr03G004092
描述	probable serine/threonine-protein kinase PBL15
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59803780 - 59806458 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014916`
GeneID	`131014916`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014916`
原始查询	`SmilChr03G004092`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable serine/threonine-protein kinase PBL15
产物	probable serine/threonine-protein kinase PBL15
Arabidopsis	`AT1G61590` (AT1G61590) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842455] identity=68.7; qcov=0.858; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0364400` (OsBBS1) - identity=59.5; qcov=0.936; evalue=2.84e-177; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014916

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799064.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057799064.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799064.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799064.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799064.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59803989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B140,B72,C13,C37
`Chr3:59803995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr3:59804079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C46
`Chr3:59804103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B14
`Chr3:59804109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:59804154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:59804181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C28,C46
`Chr3:59804274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B123,B14,B24
`Chr3:59804305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B37,B54,B86
`Chr3:59804325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr3:59804340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:59804480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799064.1

451 aa

226

451

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 127-397 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 128-399 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799064.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	127	397	1.5e-42	146.6	Protein kinase domain
`XP_057799064.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	128	399	5.9e-45	154.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943081.1
AACAACATTACCCCACAAAAAAAAAAAAAAACCTCCAAAAAATACCACCACTTTAATTAATCTATATCCAATAATAATAATAATAATAATAATAACTAATAAACCAATTAATTCCTTCACCTATAATAACATGGAATGAAACACACTCCCTCCCAACTCCCCCAACATATACCATCATTTTTTTTAAAAATTAAAAAAAAAATGAAGGTGGATCCGAAATCGAAGAAGCGGCAGCAATGGAAGCCGTTAACCGCGAGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014916
ATGAAACACACTCCCTCCCAACTCCCCCAACATATACCATCATTTTTTTTAAAAATTAAAAAAAAAATGAAGGTGGATCCGAAATCGAAGAAGCGGCAGCAATGGAAGCCGTTAACCGCGAGGTACTGCTGCTCCGCCGACGAGCACAACATCTTCGGCAACATGAGCCGATCGCGGTCGTCGAAGTCGGAGGCGTCGAAGAATTTGACGGCGCCGGCGCAGATGCCGTCGTTCAGGAAGCTGTCGTTCTCGGACAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799064.1
MKHTPSQLPQHIPSFFLKIKKKMKVDPKSKKRQQWKPLTARYCCSADEHNIFGNMSRSRSSKSEASKNLTAPAQMPSFRKLSFSDSSLRSTSGRLNEDLAQTFAGDLFDFQLSELRGATQNFAAHFLLGEGGFGRVHKAYLEEGIKPGLKSQPAAVKLLNIEGLQGHREWLAEVIFLGQLRHPNLVKLIGYCCEDEDRLLVYEFMPRGSLENHLFKRMSVCLPWATRLKIAIGAAKGLAFLHGAEKPVIYRDFKASNILL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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