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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004122`

染色体: Chr03 坐标: 60077047-60078758 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004122`
名称	SmilChr03G004122
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 5
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60077047 - 60078758 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014986`
GeneID	`131014986`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014986`
原始查询	`SmilChr03G004122`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 5
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 5
Arabidopsis	`AT4G31140` (AT4G31140) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829242] identity=68.4; qcov=0.922; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0139300` - identity=65.7; qcov=0.904; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014986

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057799150.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057799150.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799150.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799150.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799150.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60077080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B24
`Chr3:60077115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr3:60077187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:60077724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr3:60077741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr3:60078079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B10,C86
`Chr3:60078276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B9
`Chr3:60078304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:60078313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B85
`Chr3:60078376`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B68
`Chr3:60078376`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B68
`Chr3:60078411`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A23,A5,B122,B128,B20,B21,B24,B38,B39,B4,B45,B5,B58,B60,B62,B88,B93,C1,C11,C18,C23,C27,C36,C4,C42,C53,C62,C65,C69,C74,C77,C80,C84,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799150.1

477 aa

238

477

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 24-340 aa PF07983 X8 361-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799150.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	24	340	7e-69	233.5	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057799150.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	361	428	1.8e-14	54.8	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943167.1
ATGGGCAAGAACGAAGGGTTAGCAGCGGCAGGTCTTATGTTGTTGATGATGGTGAATACTGCGCATAGCATCGGCGCAAACTGGGGAACACAGGCGACTCACCCTCTGCCTCCTGCAACTGTGGTGAAGCTGCTCAAGGACAACGGGATTCAGAAGGTGAAGCTCTTCGACGCGGAGGCGCCAGTCCTCTTCGCCTTCCGAGGATCCGGGATTGAGGTCATGGTCGGAATCCCCAACGACATGCTCGCAACTCTCGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014986
ATGGGCAAGAACGAAGGGTTAGCAGCGGCAGGTCTTATGTTGTTGATGATGGTGAATACTGCGCATAGCATCGGCGCAAACTGGGGAACACAGGCGACTCACCCTCTGCCTCCTGCAACTGTGGTGAAGCTGCTCAAGGACAACGGGATTCAGAAGGTGAAGCTCTTCGACGCGGAGGCGCCAGTCCTCTTCGCCTTCCGAGGATCCGGGATTGAGGTCATGGTCGGAATCCCCAACGACATGCTCGCAACTCTCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799150.1
MGKNEGLAAAGLMLLMMVNTAHSIGANWGTQATHPLPPATVVKLLKDNGIQKVKLFDAEAPVLFAFRGSGIEVMVGIPNDMLATLAASVDAAERWVEKNVSAHMSSNSVQIKYVAVGNEPFLSTYNGTFLSTTLPALQNIQAALIKAGLGGRVKVTVPLNADVYESTAPQPSTGDFRANVKDVMVQIVDFLSRNEAPFTVNIYPFISLYNDANFPVDYAFFDGVSSPIDDNGRTYTNVFDANYDTLVWALQKNGYGNMTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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