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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004163`

染色体: Chr03 坐标: 60396169-60402565 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004163`
名称	SmilChr03G004163
描述	histidine kinase 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60396169 - 60402565 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015031`
GeneID	`131015031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015031`
原始查询	`SmilChr03G004163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histidine kinase 5-like
产物	histidine kinase 5-like
Arabidopsis	`AT5G10720` (HK5) histidine kinase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830938] identity=56.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0654300` (OsHK1) - identity=51.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000155 (phosphorelay sensor kinase activity); GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0009927 (histidine phosphotransfer kinase activity); GO:0046777 (protein autophosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00072 (Response_reg); PF00512 (HisKA); PF02518 (HATPase_c)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799208.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057799208.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057799208.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799208.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60396381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:60396946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:60397089`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B97,C55
`Chr3:60397089`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B97,C55
`Chr3:60397099`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr3:60397099`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr3:60397125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:60397189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C30
`Chr3:60397210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B12,B138,B87
`Chr3:60397992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:60398227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B12,B138,B87
`Chr3:60398394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799208.1

992 aa

496

992

HisKA

HATPase_c

Response_reg

PF00512 HisKA 372-435 aa PF02518 HATPase_c 595-670 aa PF00072 Response_reg 845-912 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799208.1`	Pfam	`PF00512`	HisKA	Domain	372	435	1.9e-18	67.0	His Kinase A (phospho-acceptor) domain
`XP_057799208.1`	Pfam	`PF02518`	HATPase_c	Domain	595	670	6.7e-27	94.8	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
`XP_057799208.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	845	912	4.1e-21	75.9	Response regulator receiver domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943225.1
CTGTATACATAGATTTACAGTTATACACGCCGGAGTATTTTCAAACGGGGAATAAAATAAGGAGTGGATAAACCTCCACATTAAACAACCACTCGAGTTTACAGCATATTGTGCAACAAACCATGCACACAGTTGCACACAGTAAACATGTTTGGGAAAGGGGAGAGAGAAACAAACAACTCAGCTGAAATTACTCATCTCTCGCTGCTGCTGCTGGCTATAAGATAAAACCCAATCAACCATTTTTCTATGCATTAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015031
ATGGGTTGTGCGATTGAGACTGATGAGTCAGACGAGATGGACATTGTCCTGTCTTCGATGTGGCCGGAGGACATGAATGAAGCCGGTAGACAGTTCAATGTGGAGAGGCCAGGAGTGGACAAAGACATGCTGGATGAGGTGACCATCAAGAGGGAGCCCGACATAGTTGATTTAAAGCGTCTCATTGAGCTCGCCAACTACACTGACAAGGGGAACTGGCAGCTGGCTAACTTGGTGAAGAATTGGGAATACAAGCAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799208.1
MGCAIETDESDEMDIVLSSMWPEDMNEAGRQFNVERPGVDKDMLDEVTIKREPDIVDLKRLIELANYTDKGNWQLANLVKNWEYKQENAVRLLREELDTLSKQQREVELKKLEILEEHRFERDGYGGERRPISILHENLKYLYQDAPRRKRDVVFQDEKISVDAEYDSVVYWKQRAMNLEKLLEASLRREQVLMGKLQESIENLEKQSTPVEELSQVLNRADNFLHFVLQNAPVVIGHQDKEMRYRFIFNHFPSLREEDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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