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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004303`

染色体: Chr03 坐标: 61399469-61401368 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004303`
名称	SmilChr03G004303
描述	uncharacterized SmilChr03G004303
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61399469 - 61401368 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015183`
GeneID	`131015183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015183`
原始查询	`SmilChr03G004303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831004]; symbol=AT5G11330; hit=AT5G11330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831004]; symbol=AT5G11330; hit=AT5G11330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G11330` (AT5G11330) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831004] identity=63.7; qcov=0.918; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0597600` - identity=53.4; qcov=0.918; evalue=4.4e-155; confidence=high
GO	GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01494 (FAD_binding_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799438.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057799438.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799438.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799438.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799438.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61399525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr3:61399530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr3:61399617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B93,D4
`Chr3:61399623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:61399641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C4
`Chr3:61399990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C4
`Chr3:61400104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C33,D8
`Chr3:61400149`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B75
`Chr3:61400149`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B75
`Chr3:61400162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B38,B39,D10
`Chr3:61400249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:61400405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799438.1

453 aa

226

453

FAD_binding_3

PF01494 FAD_binding_3 311-371 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799438.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	311	371	7.6e-14	52.4	FAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943455.1
CACGCAGTCGTTTGAAGATGAAGGAAGCAGAGAGGAAGGGGAAGGCGGTGGTGGTCGGCGGCAGCATCGCTGGGTTGTCGTGCGCGCACGCGCTGATCGCCGCCGGCTGGGGAGTAGTGGTGCTGGAGAAAACAAGCTGCCCGGCGACGGGTTGCGCCACCGGTGCCGGACTCGGGCTCGACCCCTTGGCGCAGAAAGTCATCAAGTCATGGCTCGATGAGCCTCATGCGCTTGACCTCACCACGTTGCCACTCACCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015183
ATGAAGGAAGCAGAGAGGAAGGGGAAGGCGGTGGTGGTCGGCGGCAGCATCGCTGGGTTGTCGTGCGCGCACGCGCTGATCGCCGCCGGCTGGGGAGTAGTGGTGCTGGAGAAAACAAGCTGCCCGGCGACGGGTTGCGCCACCGGTGCCGGACTCGGGCTCGACCCCTTGGCGCAGAAAGTCATCAAGTCATGGCTCGATGAGCCTCATGCGCTTGACCTCACCACGTTGCCACTCACCATTGATCAAAATGAAGCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799438.1
MKEAERKGKAVVVGGSIAGLSCAHALIAAGWGVVVLEKTSCPATGCATGAGLGLDPLAQKVIKSWLDEPHALDLTTLPLTIDQNEATDGEKKINWMLTRDESFNFRAALWSDLYGLLYKALPPETVRWGQTFLSFCVSDDGNCVRVKAKASQSGEIVEVAGDLLVAADGCLSSIRQSFFPEHKLRYSGYCAWRGVLDFSENEDSDTVLALKKAFPDLGKCLYFDLGSRTHSVFYELLNKRINWIWYVNQPEPQLTGNSVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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