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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004567`

染色体: Chr03 坐标: 63588038-63593178 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004567`
名称	SmilChr03G004567
描述	clathrin interactor EPSIN 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63588038 - 63593178 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015364`
GeneID	`131015364`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015364`
原始查询	`SmilChr03G004567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clathrin interactor EPSIN 1
产物	clathrin interactor EPSIN 1
Arabidopsis	`AT5G11710` (AT5G11710) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831043] identity=55.8; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0599900` - identity=44.7; qcov=1.15; evalue=1.66e-145; confidence=medium
GO	GO:0005543 (phospholipid binding); GO:0005768 (endosome); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006897 (endocytosis); GO:0030125 (clathrin vesicle coat); GO:0030276 (clathrin binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01417 (ENTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015364

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	1.00000	`XP_057799723.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057799723.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057799723.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057799723.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057799723.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63588345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D1
`Chr3:63588358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D1
`Chr3:63588360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:63588367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B59,C1
`Chr3:63588461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:63588483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:63588943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B46,C40
`Chr3:63589170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B53,B70
`Chr3:63589288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:63589322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:63589341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,D11
`Chr3:63589353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799723.1

540 aa

270

540

ENTH

PF01417 ENTH 27-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799723.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	27	147	1e-42	145.8	ENTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943740.1
AATTCAAAACTATACTCGGAAAATATATAAATTCGCACCTAAACCCCCCAAAAAAACACACATTTCGGTGACACAATCATTTGACGGTGCTGTCGCTTCGTCGATTCGCAAATTAGTTCAATCGATCTGTTCAATACACAGATCTTATCGAATTGAAGAATTCGATCTGTATATCTCGTCTTCCGGCAGATCCAGCCATGGATTTCATGAAGGTTTTTGATCAAACTGTCCGTGAAATAAAGAGGGAGGTGAATCTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015364
ATGGATTTCATGAAGGTTTTTGATCAAACTGTCCGTGAAATAAAGAGGGAGGTGAATCTGAAGGTGTTGAAGGTTCCAGAGATAGAACAAAAGGTTCTGGATGCTACGGATGATGAACCTTGGGGTCCTCATGGCACAGTGTTGGCAGAAATAGCACAAGCTACAAAGAAATTCACCGAATGTCAGATGGTAATGAATGTCATCTGGACAAGATTGACTGAGACTGGCAAGAATTGGCGTTTTGTCTACAAGTCGTTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799723.1
MDFMKVFDQTVREIKREVNLKVLKVPEIEQKVLDATDDEPWGPHGTVLAEIAQATKKFTECQMVMNVIWTRLTETGKNWRFVYKSLTVIEYLVGHGSERAVDDIIEHTFKISSLASFEYVEPSGKDVGINVRKKAETIVALLNNKEKMQEVRNKAAANRDKYVGLSSSGITFKSGTASFTSSSTSSDRYGGFGNTKDKESFNVGYKEDEFGEDKYGTITNSKKKSSRNGSTDQDSPTASASKTSKPDEYVSVSSQNTSSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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