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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004677`

染色体: Chr03 坐标: 64214903-64218298 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004677`
名称	SmilChr03G004677
描述	endoglucanase 16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64214903 - 64218298 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015515`
GeneID	`131015515`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015515`
原始查询	`SmilChr03G004677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoglucanase 16
产物	endoglucanase 16
Arabidopsis	`AT3G43860` (GH9A4) glycosyl hydrolase 9A4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823499] identity=69; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0778600` (OsGH9B18) - identity=64; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00759 (Glyco_hydro_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015515

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057799903.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057799903.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799903.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799903.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799903.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64215296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:64215355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B47
`Chr3:64215393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:64215395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B22,C32,C68,D2
`Chr3:64215413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C40,C84
`Chr3:64215422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,C32,C68,D2
`Chr3:64215455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B19,B26,B51,C27
`Chr3:64215482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B6,C19,D5
`Chr3:64215536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:64216108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B26,B51,C27
`Chr3:64216132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B45,C72
`Chr3:64216150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799903.1

480 aa

240

480

Glyco_hydro_9

PF00759 Glyco_hydro_9 25-470 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799903.1`	Pfam	`PF00759`	Glyco_hydro_9	Repeat	25	470	4.3e-152	508.1	Glycosyl hydrolase family 9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943920.1
ATCACAACCCAAGAACTTTTTTTCAACACACACACACACACTAGATTATTTTTTATTTTTATTTTATTTTGGCATAGGTTGATGATCCGACACATTTTGATTTTGAAATGAAGTTAGTCCGTGTAATAACATGGCTCGTGCTCTCCCTCTGTCTGTCGGCCGTAGGGGCAGATTTCGACTATCGCAGCGCCCTTACGAAGTCACTCATCTTCTTGGAGGCGCAGAGATCCGGCAAGCTCCCCAAGAGCAATAGGCTCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015515
ATGAAGTTAGTCCGTGTAATAACATGGCTCGTGCTCTCCCTCTGTCTGTCGGCCGTAGGGGCAGATTTCGACTATCGCAGCGCCCTTACGAAGTCACTCATCTTCTTGGAGGCGCAGAGATCCGGCAAGCTCCCCAAGAGCAATAGGCTCTCGTGGAGGGAAGATTCCGCCCTTGATGACGGCAAGCTCGAAAATGTAGACCTGGTGGGAGGGTACTACGACGCAGGTGATAATGTCAAGTACGGCCTCCCACTGGCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799903.1
MKLVRVITWLVLSLCLSAVGADFDYRSALTKSLIFLEAQRSGKLPKSNRLSWREDSALDDGKLENVDLVGGYYDAGDNVKYGLPLAFTVTTLSWAGIHYRQELQAAGEMDNLRLAVRWGTDYLLKASFKRNRLYVQVGDPVKDHECWIRPENMQTPRTLLKVDRNTPGTEIVAETSAALAAASVVFRGHDRPYARRLSNRAKQLFKFAKDYKGTYDGECPFYCSNSGYNDELLWAATWLYYATRRSVYLDYIQEEATSAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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