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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004718`

染色体: Chr03 坐标: 64413760-64417012 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004718`
名称	SmilChr03G004718
描述	E3 ubiquitin-protein ligase KEG
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64413760 - 64417012 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015559`
GeneID	`131015559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015559`
原始查询	`SmilChr03G004718`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase KEG
产物	E3 ubiquitin-protein ligase KEG
Arabidopsis	`AT4G32250` (AT4G32250) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829358] identity=63.9; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0639500` - identity=57.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057799966.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057799966.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057799966.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799966.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799966.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64414643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C51
`Chr3:64414668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B23,B79
`Chr3:64415337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:64415350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C84,C85
`Chr3:64415356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C84,C85
`Chr3:64415398`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	B104,B109,B113,B129,B139,B29,B34,B44,C20,C33,C84,C85
`Chr3:64415403`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B104,B109,B113,B129,B139,B29,B34,B44,C20,C33,C84,C85
`Chr3:64415404`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B104,B109,B113,B129,B139,B29,B34,B44,C20,C33,C84,C85
`Chr3:64415423`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B104,B29,B34,C84,C85
`Chr3:64415423`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B104,B29,B34,C84,C85
`Chr3:64415457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B1,B124,B7,C34
`Chr3:64415467`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B29,B9,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799966.1

624 aa

312

624

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 45-307 aa PF00069 Pkinase 48-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799966.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	45	307	3.2e-30	106.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057799966.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	48	307	2.4e-25	90.2	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943983.1
GAGAGATAAAATATTGAAAACACAGACAACGGTGGCGTACGTAAGAAAGCCACATCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATATTCTATTTAGTTCTGTTTCACTTTCTTCTCTCTCTTCTCCACTCTTTTACTTTCCCATAGCTCGTAAATATTGGTTGAATTATCGGCTCCGCAACCATGAAATGATCGCTTAATACACTGATAACTTAATTTAATTCGTCGAGATTACTGTGTTTGCTTCTTACTCAATCGATATATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015559
ATGGCAGGACAAGTTGTTGGTAATCGGCCTGCGCCTTCGTTTGATTTTGTGATGGTTGATGGAGACTCTGGTGATGTAAGCACATTAGCTGCATCATCTCACCAGATGACCCCATGGATTGATCCAACAACGATTAAGCTCAGGCACCGGATTGGGAGAGGGGCTTTTGGTGACGTTTGGCTAGCCACTCATCACCGCTCGTCTGAGGACCATGATGAGTATCATGAAGTTGCTGTGAAAATGTTGCACCCGGTCAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799966.1
MAGQVVGNRPAPSFDFVMVDGDSGDVSTLAASSHQMTPWIDPTTIKLRHRIGRGAFGDVWLATHHRSSEDHDEYHEVAVKMLHPVKEENIRDVLNRLSDLIFKCQGLDTVCLLYGLSVINKRICIVMQFYEGSVGDKMARLNGGKLSLGDVLRYGVDLAQGIMDLHAKGILILNLKPYNFLLNSNDGAVVGDIGIPYVLLGIPLPSTDMARRLGTPTYMAPEQWQPEIRGPISVETDSWGFGCSILEMLTGTQPWSGKSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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