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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000032`

染色体: Chr04 坐标: 317204-321104 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000032`
名称	SmilChr04G000032
描述	phosphatidylglycerophosphate phosphatase PTPMT2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	317204 - 321104 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022845`
GeneID	`131022845`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022845`
原始查询	`SmilChr04G000032`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylglycerophosphate phosphatase PTPMT2-like
产物	phosphatidylglycerophosphate phosphatase PTPMT2-like
Arabidopsis	`AT2G35680` (AT2G35680) Phosphotyrosine protein phosphatases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818137] identity=55.8; qcov=1.09; evalue=1.65e-123; confidence=high
Rice	`Os10g0561900` (OsPP115) - identity=58.6; qcov=0.886; evalue=1.58e-108; confidence=high
GO	GO:0004439 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0008138 (protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00782 (DSPc); PF22784 (PTP-SAK); PF22785 (Tc-R-P)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022845

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057808371.1`
2	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057808371.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057808371.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808371.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:317473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr4:317524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr4:317584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B53,C78,D3
`Chr4:317610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C12,D11
`Chr4:317614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:317635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:318040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:319271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808371.1

308 aa

154

308

PTP-SAK

Tc-R-P

DSPc

PF22784 PTP-SAK 81-181 aa PF22785 Tc-R-P 85-174 aa PF00782 DSPc 108-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808371.1`	Pfam	`PF22784`	PTP-SAK	Domain	81	181	2.9e-12	47.6	Swiss Army Knife protein, DSP-PTPase phosphatase domain
`XP_057808371.1`	Pfam	`PF22785`	Tc-R-P	Domain	85	174	2.4e-11	44.8	Polymorphic toxin system, DSP-PTPase phosphatase
`XP_057808371.1`	Pfam	`PF00782`	DSPc	Domain	108	201	1.8e-17	64.1	Dual specificity phosphatase, catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952388.1
TCTTCCGTTTTTCAACAGGATTTGTTGAGCGAAAAGGAAAGGTGGAGAGAGAAAAACTGAAATAACCCCTTTCTCTCTCATCGGTTATATTGCGTTTTTTTTTTTGGTTGGTTTAGTTTTGGCGCACACACTTTGCAAGAAAACTACACCCAACAACCATTGATAGCCTCTCCTTGCAGCATACTTCCCTAATTTACTTTTTCTCCATCTTCGAGCAATTTGTCTCCCCTTTAATTCAAGTTTTCGGGGTTTATTTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022845
ATGTATATTGAGGAATTGAAAGAGGGGGATTCTGAGTGCGTTGAGCAGCAAGTTTGTGATGATCTTTGTAAAGGTGCTTTAGTCGTTTGGGACCCGAAAAGGCTCTTGGTCGGGGCCGGGGCTCGGGCTCTTTTCTATCCCACATTGCTGTATAATGTTCTCAGGAATAAGATTCAGTCCGAGTTCCGATGGTGGGATAGGGTTGATGAGTATGTTTTGCTAGGAGCTGTTCCATTTCCAACTGACGTGCCACGCTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808371.1
MYIEELKEGDSECVEQQVCDDLCKGALVVWDPKRLLVGAGARALFYPTLLYNVLRNKIQSEFRWWDRVDEYVLLGAVPFPTDVPRLKALGVGGVVTLNEPYETLVPSSLYHDHGIEHLLIPTRDYLFAPSQGDICQAVEFIHANALCGKTTYVHCKAGRGRSTTIVLCYLVKHKQMTPGAAYEYVRSIRPRVLLASSQRQAVEDYYYELNKYAVNSRMTTLSLPERAEVEEFDDNSLVLITESDLDGYEENLESEEAGEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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