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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000120`

染色体: Chr04 坐标: 1034635-1035508 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000120`
名称	SmilChr04G000120
描述	adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1034635 - 1035508 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021104`
GeneID	`131021104`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021104`
原始查询	`SmilChr04G000120`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic-like
产物	adenylate isopentenyltransferase 5%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G19040` (IPT5) isopentenyltransferase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832023] identity=53.5; qcov=0.944; evalue=1.35e-86; confidence=high
Rice	`Os05g0311801` (OsIPT3) - identity=54; qcov=0.864; evalue=2.81e-75; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006400 (tRNA modification); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0052381 (tRNA dimethylallyltransferase activity)
KEGG	smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01715 (IPPT); PF01745 (IPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021104

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806175.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806175.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806175.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806175.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806175.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1034653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B98
`Chr4:1034655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C47
`Chr4:1034755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:1034920`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C71
`Chr4:1034920`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C71
`Chr4:1034934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr4:1034976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B85
`Chr4:1035050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr4:1035218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr4:1035227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B65,C49
`Chr4:1035285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:1035447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806175.1

287 aa

144

287

IPT

IPPT

PF01745 IPT 28-144 aa PF01715 IPPT 62-134 aa PF01715 IPPT 140-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806175.1`	Pfam	`PF01745`	IPT	Domain	28	144	7.5e-07	29.5	Isopentenyl transferase
`XP_057806175.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	62	134	8.5e-34	118.0	IPP transferase
`XP_057806175.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	140	237	8.5e-34	118.0	IPP transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950192.1
CTCTGCATGCATGCACTCGTGCCCGACGGTGAAGTTACCGAATCACCTCAACAATGAAACCCCGATCACGCTCCGCGACAGCCGCAAGGATAAGGTGGTGGTGGTGGTCGGCGCCACCGGCGCCGGAAAATCGCGGCTCTCCATCGACCTGGCCACCCGCTTCAACGGCGAGGTGATCAACTCCGACAAAATCCAGGTCTACAAGGGCCTCGACGTAATCGCCAACAAGGTCGCCGCCGACGAGCGCCGCGGTGTGCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021104
ATGCACTCGTGCCCGACGGTGAAGTTACCGAATCACCTCAACAATGAAACCCCGATCACGCTCCGCGACAGCCGCAAGGATAAGGTGGTGGTGGTGGTCGGCGCCACCGGCGCCGGAAAATCGCGGCTCTCCATCGACCTGGCCACCCGCTTCAACGGCGAGGTGATCAACTCCGACAAAATCCAGGTCTACAAGGGCCTCGACGTAATCGCCAACAAGGTCGCCGCCGACGAGCGCCGCGGTGTGCCCCACCACCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806175.1
MHSCPTVKLPNHLNNETPITLRDSRKDKVVVVVGATGAGKSRLSIDLATRFNGEVINSDKIQVYKGLDVIANKVAADERRGVPHHLLGFVDPDDDFTADDFVRHASLAAASIASRGRLPIVAGGSLSFVKALALGRAGACEFHFLWVDVAMRVLRTVLSRRVDKMVELGLVEEARGFYAPGGDYGRGIRRAVGVPELDEFFRTEAEGVADDGSREELLAAAIDEIKANTHELAYRQVEKIMRLPEDLGVELLRLDATTVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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