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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000505`

染色体: Chr04 坐标: 5511271-5516428 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000505`
名称	SmilChr04G000505
描述	CSC1-like protein At3g54510
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5511271 - 5516428 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022385`
GeneID	`131022385`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022385`
原始查询	`SmilChr04G000505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CSC1-like protein At3g54510
产物	CSC1-like protein At3g54510
Arabidopsis	`AT3G54510` (AT3G54510) Early-responsive to dehydration stress protein (ERD4) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824616] identity=58.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0950900` (OsEnS-22) - identity=54; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005227 (calcium-activated cation channel activity); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02714 (RSN1_7TM); PF13967 (RSN1_TM); PF14703 (PHM7_cyt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022385

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057807817.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057807817.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057807817.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807817.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807817.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5511475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:5511526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C41
`Chr4:5511531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C41
`Chr4:5511533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B27,B65,B66
`Chr4:5511536`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B114,B27,B65,B66
`Chr4:5511536`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B114,B27,B65,B66
`Chr4:5513678`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B87,D7
`Chr4:5513678`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B87,D7
`Chr4:5513926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B23,C11,C69
`Chr4:5514261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:5514320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B7,B88,B96
`Chr4:5515440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B7,B88,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807817.1

714 aa

357

714

RSN1_TM

PHM7_cyt

RSN1_7TM

PF13967 RSN1_TM 6-165 aa PF14703 PHM7_cyt 186-344 aa PF02714 RSN1_7TM 356-623 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807817.1`	Pfam	`PF13967`	RSN1_TM	Family	6	165	3.4e-35	121.8	Late exocytosis, associated with Golgi transport
`XP_057807817.1`	Pfam	`PF14703`	PHM7_cyt	Domain	186	344	1.4e-26	94.5	Cytosolic domain of 10TM putative phosphate transporter
`XP_057807817.1`	Pfam	`PF02714`	RSN1_7TM	Family	356	623	2.7e-73	247.4	Calcium-dependent channel, 7TM region, putative phosphate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951834.1
TCATGCAATCACGTCTTGGCAGTGTGGCCACCTTGTGAGTCGGCCACGTTTAATAGGGTTTCCGACATCCCCAATTCACTCTCTCTTTCCCTAAATCCAAACCCACAAACTGAATGTTGACATGAATGCAGAGAGCTTGCTGGCTTCCGCCTCCATCAACATCGGCTTCGCTCTCCTCATTCTCTCTCTCTTCTCCATCCTCCAGAAGCAGCCCTCCAATGCTCCCATCTACTTCGCCCGCCGCCTCTCCCAGCACCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022385
ATGAATGCAGAGAGCTTGCTGGCTTCCGCCTCCATCAACATCGGCTTCGCTCTCCTCATTCTCTCTCTCTTCTCCATCCTCCAGAAGCAGCCCTCCAATGCTCCCATCTACTTCGCCCGCCGCCTCTCCCAGCACCGCCCCGTCTCCCTCCACCCCCGCCTCACCGTCCGCCGCCTCCTCCCCTCGCCCGCCTGGATCCGCGTCGCCCTCTCCATCACCGAAGACGAGATTCTTGACACTTGTGGCCTCGATGTCCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807817.1
MNAESLLASASINIGFALLILSLFSILQKQPSNAPIYFARRLSQHRPVSLHPRLTVRRLLPSPAWIRVALSITEDEILDTCGLDVLIFIRLFKFGINFFLVCSLVGLFVLVPLNYIAGDGEQPGHSHSMDAFTITNISKGSDWLWVHCSCLYFVSSYGLYLLYKEYEDILVKRIQQLHLMRHEPNQFTVLVREIPYCDEHKAHDCAVDHFFSKYHPHSYQSYQILYDGRELDKLLNQAKSIRGKIEKLRHRSANKKQSTD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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