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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000525`

染色体: Chr04 坐标: 5767049-5771100 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000525`
名称	SmilChr04G000525
描述	uridine 5'-monophosphate synthase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5767049 - 5771100 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022407`
GeneID	`131022407`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022407`
原始查询	`SmilChr04G000525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uridine 5'-monophosphate synthase
产物	uridine 5'-monophosphate synthase
Arabidopsis	`AT3G54470` (AT3G54470) uridine 5'-monophosphate synthase / UMP synthase (PYRE-F) (UMPS) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824612] identity=78.4; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0951200` (UMPS1) - identity=73.2; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004588 (orotate phosphoribosyltransferase activity); GO:0004590 (orotidine-5'-phosphate decarboxylase activity); GO:0006207 ('de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process); GO:0044205 ('de novo' UMP biosynthetic process)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00215 (OMPdecase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022407

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807855.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057807855.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807855.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807855.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5767793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B25
`Chr4:5767814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,D11
`Chr4:5767815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:5767922`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C30
`Chr4:5767922`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C30
`Chr4:5768044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:5768752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr4:5768753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr4:5769615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B95,B99
`Chr4:5770878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B117,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807855.1

483 aa

242

483

OMPdecase

PF00215 OMPdecase 251-470 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807855.1`	Pfam	`PF00215`	OMPdecase	Domain	251	470	5.3e-61	207.0	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951872.1
AAATTGTAGTGGGTGTCCTGCACCTGAACCGACCCGGATATATTTATTAAGGAAAAAATTTAAATTCTCCAGCCCTAGACTGCGGCGTCTTCTCTGGGTTCTCTCTCCTCTCAATCTCTCTTCTCCGCGGCTCGCCGACCCACCCCTCCGGCGTCGGCTCGCTGGTCCGCTCTTCAGCTCTCTCTCGGTCCCTCCGTCACACACTAGAATGTCATCTCCTCCGCCGCTATCAATGGACATGGAGTCGCTAATCCTGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022407
ATGTCATCTCCTCCGCCGCTATCAATGGACATGGAGTCGCTAATCCTGCAGCTCCACGATATCGCCGCCGTCAAATTCGGCAACTTCAAGCTCAAATCCGGCATCTCCTCCCCAATCTACATCGACCTCCGCCTCATCGTCTCCTACCCTTCCCTGCTCAGCCAAATCTCCCGGACAATCGCCGCCACCGTCCCATCCTCCGCCCACTATGACGTCATCTGCGGCGTCCCCTACACCGCTCTCCCCATCGCCACCTGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807855.1
MSSPPPLSMDMESLILQLHDIAAVKFGNFKLKSGISSPIYIDLRLIVSYPSLLSQISRTIAATVPSSAHYDVICGVPYTALPIATCISVASNIPMLMRRKEVKDYGTAKAIEGAFQQNQVCLIVEDLVTSGASVLETAAPLRAVGLKVTDAVVMIDREQGGRENLAQNGITLHSMVKLTEMVRILKEKGRVSEETENTVKKFLEENRQVSVPLAAVADKKLTVRVPFEERAKMAKNPTGRKLFEIMKKKESNLCLAADVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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