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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000530`

染色体: Chr04 坐标: 5828579-5835849 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000530`
名称	SmilChr04G000530
描述	F-box protein At3g54460
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5828579 - 5835849 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022412`
GeneID	`131022412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022412`
原始查询	`SmilChr04G000530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At3g54460
产物	F-box protein At3g54460
Arabidopsis	`AT3G54460` (AT3G54460) SNF2 domain-containing protein / helicase domain-containing protein / F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824611] identity=53.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0952200` (OsFbox058) - identity=57.4; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0140658 (ATP-dependent chromatin remodeler activity)
KEGG	-
Pfam	PF00176 (SNF2-rel_dom); PF00271 (Helicase_C); PF07496 (zf-CW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807863.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057807863.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807863.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807863.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807863.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5828715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:5831331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr4:5831386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr4:5831439`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr4:5831439`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr4:5831451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:5831656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C48
`Chr4:5832376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B9,C54,C57
`Chr4:5832474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:5832586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B7,B96
`Chr4:5832846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:5832854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807863.1

1348 aa

674

1348

SNF2-rel_dom

zf-CW

Helicase_C

PF00176 SNF2-rel_dom 290-962 aa PF07496 zf-CW 551-594 aa PF00271 Helicase_C 1178-1273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807863.1`	Pfam	`PF00176`	SNF2-rel_dom	Domain	290	962	3.1e-68	230.7	SNF2-related domain
`XP_057807863.1`	Pfam	`PF07496`	zf-CW	Domain	551	594	5.5e-14	52.6	CW-type Zinc Finger
`XP_057807863.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	1178	1273	3.8e-10	40.7	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951880.1
AAGTTAATTTTGTTTCGGAAAGGAATTAGTATTGTTGAAGGAAGTTAATCTTATACATCGAAAATCCAAATTTGGGAAAATTAAATCGTTTTCCCTTCTCCAATGAATCAATGAGCAGTATCATCTTCGCACCCACAGACTCGTGAGCAGGGAATTCCTCCTTCCACAAACCCAAGCACATGGAAAACGACGTCGAGCCGCCGCCTGATCACAAGCTCTGCGGATACCTCTGTGCCGTTCTCACACTTCCCGTCGATGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022412
ATGGAAAACGACGTCGAGCCGCCGCCTGATCACAAGCTCTGCGGATACCTCTGTGCCGTTCTCACACTTCCCGTCGATGCCTCTGTCCCCCTCAACTCGGTTTGCCGCGTCGCCGGCGACAACGCCCAAGTCTACTTCGCCGCGCAGGACGGCGCCCGCTTGACCCTCATTGGCGAATCGGAACCTCCTGATTCCAAAGCGACGCCGTTAGCGAAGAAGCGGTGGAGCAGGATTGGAATGGTGCACGGATCAATCAGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807863.1
MENDVEPPPDHKLCGYLCAVLTLPVDASVPLNSVCRVAGDNAQVYFAAQDGARLTLIGESEPPDSKATPLAKKRWSRIGMVHGSISVVRQLHALVAHKCLWILARLVHVSPCQSGVESGSREFRAVVLVDVYLPVDLWSGWQFPRSGSIAAALFKHLSCDWEARSSMLNSIRLNHESPHSIWNVTDCHVLGCERHCSAPNNPKKKKVFELQEIFKSLPCVSMKVDSACSRVMPEDSSNESGIWVLSDDITINILTALSPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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