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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000538`

染色体: Chr04 坐标: 5988411-5989361 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000538`
名称	SmilChr04G000538
描述	uncharacterized SmilChr04G000538
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	5988411 - 5989361 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022900`
GeneID	`131022900`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022900`
原始查询	`SmilChr04G000538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.2; qcov=1.02; evalue=1.12e-37; confidence=low
Rice	`Os01g0595300` - identity=29.2; qcov=0.975; evalue=4.83e-41; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022900

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808426.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808426.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808426.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808426.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808426.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:5988461`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr4:5988461`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B91
`Chr4:5988481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C1
`Chr4:5988494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C47
`Chr4:5988571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B128,C47,C84
`Chr4:5988597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr4:5988611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr4:5988633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B63
`Chr4:5988646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:5988664`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B21,B22,B36,B47,B49,B72,B99,C29,C40,C7,C71
`Chr4:5988696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B139,C37
`Chr4:5988700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808426.1

316 aa

158

316

Transposase_mut

MULE

SWIM

PF00872 Transposase_mut 41-141 aa PF10551 MULE 42-136 aa PF04434 SWIM 286-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808426.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	41	141	2e-12	47.4	Transposase, Mutator family
`XP_057808426.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	42	136	3e-23	82.7	MULE transposase domain
`XP_057808426.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	286	315	0.00053	20.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952443.1
ATGGTGCAGCACTGCAATAAGGACTCGATTATTGATTTGGAGACTGATGGAGATGGTGTATTTAGGTACTATTTTTTGGCTCTTGGTGCATCTATTCATGGTTTCTTATCATCTGGTCGTCCTGTTATAGTTGTTGATGCTACACATTTGAAAGGTAAGTTTAAGGGTGTGATGTTTGTTGGTGTGACTAAAGATGGCAATGAACAAGTTTTTCCACTAGCTATGGGGCTTGGTGATAAGGAGAATGATAGGTCATGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022900
ATGGTGCAGCACTGCAATAAGGACTCGATTATTGATTTGGAGACTGATGGAGATGGTGTATTTAGGTACTATTTTTTGGCTCTTGGTGCATCTATTCATGGTTTCTTATCATCTGGTCGTCCTGTTATAGTTGTTGATGCTACACATTTGAAAGGTAAGTTTAAGGGTGTGATGTTTGTTGGTGTGACTAAAGATGGCAATGAACAAGTTTTTCCACTAGCTATGGGGCTTGGTGATAAGGAGAATGATAGGTCATGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808426.1
MVQHCNKDSIIDLETDGDGVFRYYFLALGASIHGFLSSGRPVIVVDATHLKGKFKGVMFVGVTKDGNEQVFPLAMGLGDKENDRSWSWFFTRLRRAFGVPNNLLFVSDQHLSIKNAIEAVFPRIHHCLCTYHLQKNLARYGANTVAVFQRAANSYKREQYDLHGGQLALVCDKGAYTKLMDLQPSRWACSHSTVRRYNFMTSNCSEVFNGRLRWGRRLPVCTLFEFVRTLIAHWFQERRGKALSRSHTLTERAALKLDIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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