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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000626`

染色体: Chr04 坐标: 7126377-7133897 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000626`
名称	SmilChr04G000626
描述	aldehyde oxidase GLOX
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7126377 - 7133897 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022917`
GeneID	`131022917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022917`
原始查询	`SmilChr04G000626`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aldehyde oxidase GLOX
产物	aldehyde oxidase GLOX
Arabidopsis	`AT3G53950` (AT3G53950) glyoxal oxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824562] identity=64.8; qcov=0.368; evalue=5.03e-170; confidence=low
Rice	`Os03g0258900` - identity=47.1; qcov=0.373; evalue=1.28e-99; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07250 (Glyoxal_oxid_N); PF07727 (RVT_2); PF09118 (GO-like_E_set)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057808442.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057808442.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808442.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057808442.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808442.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7126451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B47,B91,C23,C84
`Chr4:7126617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:7126774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C39
`Chr4:7126944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A25,B74,B8
`Chr4:7126982`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr4:7126982`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr4:7126985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:7127114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C23
`Chr4:7127243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D10
`Chr4:7127249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:7127346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr4:7127360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C39,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808442.1

1002 aa

501

1002

Glyoxal_oxid_N

RVT_2

Glyoxal_oxid_N

GO-like_E_set

PF07250 Glyoxal_oxid_N 86-408 aa PF07727 RVT_2 457-532 aa PF07250 Glyoxal_oxid_N 827-886 aa PF09118 GO-like_E_set 895-996 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808442.1`	Pfam	`PF07250`	Glyoxal_oxid_N	Repeat	86	408	2e-159	531.1	Glyoxal oxidase N-terminus
`XP_057808442.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	457	532	7.9e-16	59.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057808442.1`	Pfam	`PF07250`	Glyoxal_oxid_N	Repeat	827	886	2e-159	531.1	Glyoxal oxidase N-terminus
`XP_057808442.1`	Pfam	`PF09118`	GO-like_E_set	Domain	895	996	2e-27	96.1	Galactose oxidase-like, Early set domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952459.1
TCATAGTAATATTTTAGTTATTTAAGCGAATATTTTGTAGTGGTATCTTTAGGCATGTGGTACGTCATCGTTTTGAGCTTTTTCAAACTAGCGACATCACCATCTACACTTCCACTGACACAAATTCACTGCAACTCTCTACTCCAAAGTAGAGAAGAAGAAAACTTGGTTTCAACTCTCCCCACTTTCTCTCTACACCCACTCATGACTAACCTTCTACTCCTCCTCCTCCTCGTTTTCGTCGCACGCGCCGCCGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022917
ATGTGGTACGTCATCGTTTTGAGCTTTTTCAAACTAGCGACATCACCATCTACACTTCCACTGACACAAATTCACTGCAACTCTCTACTCCAAAGTAGAGAAGAAGAAAACTTGGTTTCAACTCTCCCCACTTTCTCTCTACACCCACTCATGACTAACCTTCTACTCCTCCTCCTCCTCGTTTTCGTCGCACGCGCCGCCGCGGACCTCCCGGGCGCGTGGGAGCTCCTCGTCGCCGACGCCGGCATCGCCTCCATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808442.1
MWYVIVLSFFKLATSPSTLPLTQIHCNSLLQSREEENLVSTLPTFSLHPLMTNLLLLLLLVFVARAAADLPGAWELLVADAGIASMHTAVTRFNTVVLLDRTHIGPSRKFLPENRCLPNPVHPHRKDCTAHSVVLDLKTNALRPLTILTDTWCSSGQFLPDGSLIQTGGDLDGFRKIRRFTPCEPGSFCDWEELQDAQLYRGRWYATNQILPEGSVIIIGGKAASSVEYFPPRKGAVDFSFLSQVEDNQMDNLYPYVHLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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