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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000648`

染色体: Chr04 坐标: 7309589-7313157 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000648`
名称	SmilChr04G000648
描述	uracil phosphoribosyltransferase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7309589 - 7313157 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022499`
GeneID	`131022499`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022499`
原始查询	`SmilChr04G000648`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uracil phosphoribosyltransferase
产物	uracil phosphoribosyltransferase
Arabidopsis	`AT3G53900` (UPP) uracil phosphoribosyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824557] identity=74; qcov=0.888; evalue=1.61e-133; confidence=high
Rice	`Os05g0455700` - identity=70.6; qcov=0.91; evalue=4.11e-128; confidence=high
GO	GO:0004845 (uracil phosphoribosyltransferase activity); GO:0006223 (uracil salvage)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00156 (Pribosyltran); PF14681 (UPRTase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022499

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057807996.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057807996.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807996.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807996.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7309944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B79,C8
`Chr4:7311409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:7311710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,B89,B94
`Chr4:7311741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B129,C10,C31
`Chr4:7312811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B105,C13,C51,D11
`Chr4:7312857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C57,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807996.1

281 aa

140

281

UPRTase

Pribosyltran

PF14681 UPRTase 74-281 aa PF00156 Pribosyltran 138-236 aa

XP_057807997.1

277 aa

138

277

UPRTase

Pribosyltran

PF14681 UPRTase 70-277 aa PF00156 Pribosyltran 134-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807996.1`	Pfam	`PF14681`	UPRTase	Domain	74	281	1.2e-68	231.4	Uracil phosphoribosyltransferase
`XP_057807996.1`	Pfam	`PF00156`	Pribosyltran	Domain	138	236	2.6e-13	50.3	Phosphoribosyl transferase domain
`XP_057807997.1`	Pfam	`PF14681`	UPRTase	Domain	70	277	1.1e-68	231.5	Uracil phosphoribosyltransferase
`XP_057807997.1`	Pfam	`PF00156`	Pribosyltran	Domain	134	232	2.5e-13	50.4	Phosphoribosyl transferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952014.1
CAGAATAATTCCATTAGTCGAATTGCTGAATTAAATCCTCAATGTTGCCAAATACAGACAAGTAAATAAACTTTTCCCGAAATACTTTTGGAAATTGGAACAGAGAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAAATCTGATGCGGTAGGCCTCACCGCAACCTCCGTGCTCTCCCTCAACGCAACCCGAAATATCTCGACGAATTTCGATTCGTTCCCAGTTTCCTAGTGTCTTTGGATTCTTTTTAGCATTAAAAATGGCTTTT...

XM_057952013.1
CAGAATAATTCCATTAGTCGAATTGCTGAATTAAATCCTCAATGTTGCCAAATACAGACAAGTAAATAAACTTTTCCCGAAATACTTTTGGAAATTGGAACAGAGAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAAATCTGATGCGGTAGGCCTCACCGCAACCTCCGTGCTCTCCCTCAACGCAACCCGAAATATCTCGACGAATTTCGATTCGTTCCCAGTTTCCTAGTGTCTTTGGATTCTTTTTAGCATTAAAAATGGCTTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022499
ATGGCTTTTTCCGTTATGAATTCACCGCTTCTGCGATACCCCTGCACCTCGACGCTCCTCCACATTCCCCAACACCCATCCGCACTCAATCCCGCCTCATCTGATAAGGTTTTGCGCTGGGAGTGTCGTAAACGGCGCGCCATTACCATGAATTGCCAAGCCACGGCGGAGAAATCTGTTGTGTCTGGGAGTAGAATGCTGGTATTCGTCCCGCCGCATCCTTTAATTAAGCATTGGATTTCAGTTCTTCGGAATGACCA...

LOC131022499
ATGGCTTTTTCCGTTATGAATTCACCGCTTCTGCGATACCCCTGCACCTCGACGCTCCTCCACATTCCCCAACACCCATCCGCACTCAATCCCGCCTCATCTGATATAATTAATCCCAAGGTTTTGCGCTGGGAGTGTCGTAAACGGCGCGCCATTACCATGAATTGCCAAGCCACGGCGGAGAAATCTGTTGTGTCTGGGAGTAGAATGCTGGTATTCGTCCCGCCGCATCCTTTAATTAAGCATTGGATTTCAGTTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807996.1
MAFSVMNSPLLRYPCTSTLLHIPQHPSALNPASSDIINPKVLRWECRKRRAITMNCQATAEKSVVSGSRMLVFVPPHPLIKHWISVLRNDQTPCPIFKNAMAELGRLLIYEASREWLPTISGEIQSPMGPASVEFIDPREPIAIVPILRAGLALAEHAPSVLPATNTYHLGISRNEETLQPSVYLNKLPEKFPEGSRVFVVDPMLATGGTVVAAIQLIKDRGVDNKQIKVISAVAAPPALQKLSEKFPGLHVYAGILDPT...

XP_057807997.1
MAFSVMNSPLLRYPCTSTLLHIPQHPSALNPASSDKVLRWECRKRRAITMNCQATAEKSVVSGSRMLVFVPPHPLIKHWISVLRNDQTPCPIFKNAMAELGRLLIYEASREWLPTISGEIQSPMGPASVEFIDPREPIAIVPILRAGLALAEHAPSVLPATNTYHLGISRNEETLQPSVYLNKLPEKFPEGSRVFVVDPMLATGGTVVAAIQLIKDRGVDNKQIKVISAVAAPPALQKLSEKFPGLHVYAGILDPTVNEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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