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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000696`

染色体: Chr04 坐标: 8129588-8135392 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000696`
名称	SmilChr04G000696
描述	protein DEFECTIVE IN EXINE FORMATION 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	8129588 - 8135392 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022565`
GeneID	`131022565`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022565`
原始查询	`SmilChr04G000696`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DEFECTIVE IN EXINE FORMATION 1
产物	protein DEFECTIVE IN EXINE FORMATION 1
Arabidopsis	`AT3G09090` (DEX1) defective in exine formation protein (DEX1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820063] identity=69.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0825700` (Os) - identity=66.7; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13517 (FG-GAP_3); PF23722 (Beta-sand_DEX1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022565

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057808058.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057808058.1`
3	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057808058.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057808058.1`
5	Cis-golgi network	Cis-golgi network	0.20000	`XP_057808058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:8130759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr4:8131841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr4:8132055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B48
`Chr4:8132196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:8133966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C83
`Chr4:8134783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:8134894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808058.1

890 aa

445

890

FG-GAP_3

Beta-sand_DEX1

PF13517 FG-GAP_3 551-607 aa PF23722 Beta-sand_DEX1 744-848 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808058.1`	Pfam	`PF13517`	FG-GAP_3	Repeat	551	607	3.1e-20	73.2	FG-GAP-like repeat
`XP_057808058.1`	Pfam	`PF23722`	Beta-sand_DEX1	Domain	744	848	1.6e-35	122.4	DEX1 beta-sandwich

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952075.1
CGTGGAAGTTCTTGCGCCTAATTCATGAAAACTTGGAATTTTGCGTTCCTCAGTTTTCTTGTTTTTGCGGTATTGTGTTTGAGTTTCGATCATGGCTCATCTCAATCGGAGGAGGCTAAAAAGAATAAATTTAGAGAGCGTGAGGCCACTGATGATGCTCTTGGTTACCCCAATTTCGATGAGGACGAGCTGTTGAATACACAATGCCCTCGGCATTTGGAACTTAGGTGGCAAGCGGAAGTGAGTTCTAGCATATATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022565
ATGAAAACTTGGAATTTTGCGTTCCTCAGTTTTCTTGTTTTTGCGGTATTGTGTTTGAGTTTCGATCATGGCTCATCTCAATCGGAGGAGGCTAAAAAGAATAAATTTAGAGAGCGTGAGGCCACTGATGATGCTCTTGGTTACCCCAATTTCGATGAGGACGAGCTGTTGAATACACAATGCCCTCGGCATTTGGAACTTAGGTGGCAAGCGGAAGTGAGTTCTAGCATATATGCAACTCCGTTGGTTGCAGACATTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808058.1
MKTWNFAFLSFLVFAVLCLSFDHGSSQSEEAKKNKFREREATDDALGYPNFDEDELLNTQCPRHLELRWQAEVSSSIYATPLVADINSDGKLEVVVPSFVHYLEVLEGSDGDKLPGWPAFHQSTVHSSPLLYDIDKDGVREIALATYNGEVLFFRVSGYMMSDKLEIPRLKVKKDWHIGLLPDPADRSHPDVDDAQLIQDALVESLHQPNASTLAENTLHSTASHHDLSNPIPEEVHHDTLNSTISSDIQNSQLNGSTLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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