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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000859`

染色体: Chr04 坐标: 10903742-10905247 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000859`
名称	SmilChr04G000859
描述	protein NODULATION SIGNALING PATHWAY 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10903742 - 10905247 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022989`
GeneID	`131022989`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022989`
原始查询	`SmilChr04G000859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NODULATION SIGNALING PATHWAY 2-like
产物	protein NODULATION SIGNALING PATHWAY 2-like
Arabidopsis	`AT4G08250` (AT4G08250) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826375] identity=24.4; qcov=0.786; evalue=7.76e-20; confidence=weak
Rice	`Os03g0263300` (NSP2) - identity=24.9; qcov=0.723; evalue=5.65e-13; confidence=weak
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022989

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808512.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808512.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808512.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808512.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10903791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr4:10904179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B83,C59
`Chr4:10904374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C79
`Chr4:10904473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:10904512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:10904548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:10904626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C79
`Chr4:10904804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:10904916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C56
`Chr4:10904944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:10904981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B35,B54,B82
`Chr4:10905051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808512.1

501 aa

250

501

GRAS

PF03514 GRAS 199-500 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808512.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	199	500	2.8e-33	116.1	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952529.1
ATGATGCAACCGGAGCTGCTTATGCCCACATGGCCAAACTACAACTTTGCTTGCTCACCGTTTGATCAAAAGGTGTTGTATGATCAAGAAATGGATCTTTGTGTGGTTGATGACTGTGATTTTTCCTATTCATTCATCACATCACCTCAAGACTCCTCTGTTTTGTCTTCAAACTCATGCATCCCAGCCATGATCCTAGATGAGTATCTTGATCTAAAAGATTCGTGCAACGAATTTCAAACATCTTCAGCCATGGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022989
ATGATGCAACCGGAGCTGCTTATGCCCACATGGCCAAACTACAACTTTGCTTGCTCACCGTTTGATCAAAAGGTGTTGTATGATCAAGAAATGGATCTTTGTGTGGTTGATGACTGTGATTTTTCCTATTCATTCATCACATCACCTCAAGACTCCTCTGTTTTGTCTTCAAACTCATGCATCCCAGCCATGATCCTAGATGAGTATCTTGATCTAAAAGATTCGTGCAACGAATTTCAAACATCTTCAGCCATGGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808512.1
MMQPELLMPTWPNYNFACSPFDQKVLYDQEMDLCVVDDCDFSYSFITSPQDSSVLSSNSCIPAMILDEYLDLKDSCNEFQTSSAMDGMEIISRGDIEGICEWINGDGYIQEDSSSHDLVMEGDDGWSPSLSSDSHALAETDAELTLIHLMRAYGEAEENGERELGEVLVGAINGKSSPLGSTSERVAYNLFGAKEGRGEENLMAAFRVMYQGLPNGRLAHFTANAAILDSIPDDVGMVQIVDFDMGEGIQWPPLMEALGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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