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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000867`

染色体: Chr04 坐标: 10946547-10947483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000867`
名称	SmilChr04G000867
描述	deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10946547 - 10947483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022697`
GeneID	`131022697`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022697`
原始查询	`SmilChr04G000867`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like
产物	deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase-like
Arabidopsis	`AT3G46940` (DUT1) DUTP-PYROPHOSPHATASE-LIKE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823847] identity=81.3; qcov=0.957; evalue=3.23e-88; confidence=high
Rice	`Os03g0669100` - identity=78.1; qcov=0.846; evalue=1.04e-73; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004170 (dUTP diphosphatase activity); GO:0006226 (dUMP biosynthetic process); GO:0046081 (dUTP catabolic process)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00692 (dUTPase); PF22769 (DCD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022697

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808195.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808195.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808195.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808195.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808195.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10946723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:10946813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C33,C60,C7
`Chr4:10946827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B41,D6
`Chr4:10946967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B54,B89
`Chr4:10947217`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B128
`Chr4:10947217`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B128
`Chr4:10947303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808195.1

162 aa

162

dUTPase

DCD

PF00692 dUTPase 33-161 aa PF22769 DCD 62-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808195.1`	Pfam	`PF00692`	dUTPase	Domain	33	161	2.7e-46	157.3	dUTPase
`XP_057808195.1`	Pfam	`PF22769`	DCD	Domain	62	135	6.1e-09	36.9	dCTP deaminase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952212.1
AAATTTACCCCCAATTTTCCAACTCCCAAGAATTGCTCCTCCATTTAAACCCTACGCTGCTCTGACTCCTACTTTTCATCATCTGCAAATTCTCCCCACTCCCGAATCGCAAAATTACTTGGATTCATTCGAAAATGGCTAAGGTGGCGGAGAATCCCAACCACAACGGCGTTTCTGACGCTAAGCCCACTGCAATTGCGCCGTTTCTGCGGGTGAAAAGGCTCTCGGAGAAAGCCGTTTTGCCGTCTAGGGCTTCCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022697
ATGGCTAAGGTGGCGGAGAATCCCAACCACAACGGCGTTTCTGACGCTAAGCCCACTGCAATTGCGCCGTTTCTGCGGGTGAAAAGGCTCTCGGAGAAAGCCGTTTTGCCGTCTAGGGCTTCCCCTCTTTCAGCCGGCTACGATCTCTCAAGCGCCGTGGATACGAAAGTTCCGGCGAGAGGAAAAGCCCTGGTGCCAACGGATCTCAGCGTCGCCGTTCCCGAAGGAACGTATGCTCGAATTGCGCCGCGGTCTGGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808195.1
MAKVAENPNHNGVSDAKPTAIAPFLRVKRLSEKAVLPSRASPLSAGYDLSSAVDTKVPARGKALVPTDLSVAVPEGTYARIAPRSGLAWKHSIDVGAGVVDADYRGPVGVILFNHSDVDFEVKVGDRIAQLMIEKIVTPEVAEVDDLDSTARGSGGFGSTGV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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