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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000906`

染色体: Chr04 坐标: 11789200-11791683 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000906`
名称	SmilChr04G000906
描述	probable WRKY transcription factor 26
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11789200 - 11791683 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022730`
GeneID	`131022730`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022730`
原始查询	`SmilChr04G000906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 26
产物	probable WRKY transcription factor 26
Arabidopsis	`AT2G38470` (WRKY33) WRKY DNA-binding protein 33 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818429] identity=51.5; qcov=0.959; evalue=1.35e-100; confidence=high
Rice	`Os01g0826400` (OsWRKY24) - identity=64.5; qcov=0.591; evalue=1.38e-93; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022730

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808229.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808229.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808229.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808229.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808229.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11789633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr4:11790297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B64,B65,B77
`Chr4:11790519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:11791245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr4:11791276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B24,B5,B52
`Chr4:11791354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:11791456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B130,B8,C53,C87
`Chr4:11791498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:11791569`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A14
`Chr4:11791569`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808229.1

391 aa

196

391

WRKY

PF03106 WRKY 143-198 aa PF03106 WRKY 272-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808229.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	143	198	9.9e-52	173.7	WRKY DNA -binding domain
`XP_057808229.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	272	329	9.9e-52	173.7	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952246.1
TCTCCAATCTCTCTCTCTCTCTCCCTCACTATACTAATTATAGAATCTCTCTGATGGCGTCTTCAGGTGGCAGCTTGAACCCAGCCCTAAATTCTTTCCATTACAATCCCACATCCCAATACATGAATTCCTTCACCGATCTCCTCACATCAAACAAAGATCACTACGAAGAGAAATACTCATTCCCGCCTCTCTCTCCTCCGCCTCTCTCTCCTTCCTTCTTCCTCGACTCTCCCGCCCTCTTCGGATCATCCAATGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022730
ATGGCGTCTTCAGGTGGCAGCTTGAACCCAGCCCTAAATTCTTTCCATTACAATCCCACATCCCAATACATGAATTCCTTCACCGATCTCCTCACATCAAACAAAGATCACTACGAAGAGAAATACTCATTCCCGCCTCTCTCTCCTCCGCCTCTCTCTCCTTCCTTCTTCCTCGACTCTCCCGCCCTCTTCGGATCATCCAATGCCCTCCCATCTCCCACCACCGGAGCCTTCGCCGCGCTCTTCGCCAAGGACGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808229.1
MASSGGSLNPALNSFHYNPTSQYMNSFTDLLTSNKDHYEEKYSFPPLSPPPLSPSFFLDSPALFGSSNALPSPTTGAFAALFAKDDGPAFSDFSFHSQTRPSDPSAALITSKDCVKRQREEESWIRKVEEVPRSYVREQGKSDDGYNWRKYGQKQVKGSENPRSYYKCTFANCPTKKKVERNLDGCVTEIVYKGSHNHGKPHAARRNLDTNSPSVSDDQASTSITNSTDDNANDHVAKRWKGDDENESGCGSRAVREPRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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