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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001090`

染色体: Chr04 坐标: 15617053-15618840 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001090`
名称	SmilChr04G001090
描述	serine/threonine-protein kinase STN8, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15617053 - 15618840 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019803`
GeneID	`131019803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019803`
原始查询	`SmilChr04G001090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase STN8, chloroplastic
产物	serine/threonine-protein kinase STN8%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G01920` (STN8) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831741] identity=69.7; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0480000` (OsSTN8) - identity=72.5; qcov=0.831; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF03109 (ABC1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804376.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057804376.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057804376.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057804376.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057804376.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15617433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C62,D3
`Chr4:15617467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B52
`Chr4:15617514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:15617643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B83,C59
`Chr4:15617791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,C16,C62,D3
`Chr4:15618397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:15618583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,C16,C62,D3
`Chr4:15618700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,C16,C62,D3
`Chr4:15618822`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	B104,B106,B113,B117,B120,B62,B66,B75,B82,B89,C79,C81,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804376.1

478 aa

239

478

PK_Tyr_Ser-Thr

ABC1

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 217-337 aa PF03109 ABC1 251-315 aa PF00069 Pkinase 260-337 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804376.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	217	337	2.5e-10	40.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057804376.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	251	315	2.3e-07	30.9	ABC1 atypical kinase-like domain
`XP_057804376.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	260	337	1.8e-22	80.7	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948393.1
ATGGCCTCTCTCGTATCCCCCACCGCCACCGCCACCGCGCTTCAATTCCGCCGCTCAAACCACAGCTTGATCTGGTCCGTGAGCAGGAGGAATTTCGCCATCAAATGCAATGCGCTCTTCAACGACAATCTCTTCATCGACAGTTCCCTCCATTTGGAGCAGTCCCTCTCCCAATTCCAGCAGCTCCCCGAAGTCGAGAAATGGGGCTTACTGGTTTTCGCCGGCGTTTCCTGGATTTACTTGACTGCGAGGCCCGGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019803
ATGGCCTCTCTCGTATCCCCCACCGCCACCGCCACCGCGCTTCAATTCCGCCGCTCAAACCACAGCTTGATCTGGTCCGTGAGCAGGAGGAATTTCGCCATCAAATGCAATGCGCTCTTCAACGACAATCTCTTCATCGACAGTTCCCTCCATTTGGAGCAGTCCCTCTCCCAATTCCAGCAGCTCCCCGAAGTCGAGAAATGGGGCTTACTGGTTTTCGCCGGCGTTTCCTGGATTTACTTGACTGCGAGGCCCGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804376.1
MASLVSPTATATALQFRRSNHSLIWSVSRRNFAIKCNALFNDNLFIDSSLHLEQSLSQFQQLPEVEKWGLLVFAGVSWIYLTARPGVLIGAIDAYILAPLQVGLDTLTGRRSLKRTDFLVGDRVGEGSFGIVYSGVVVPKNMNVDENLRSKSSRNRIDQRFKDKVILKKVKIGVQGAVECGEFEEWFNYRLSRAAPETCAEFLGSFVADKTNTLFTKGEKWLVWKYEGDLDLGDYMKDRSFPLNLESVMFGRVLQGLESM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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