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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001094`

染色体: Chr04 坐标: 15654241-15656138 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001094`
名称	SmilChr04G001094
描述	probable WRKY transcription factor 70
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15654241 - 15656138 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019815`
GeneID	`131019815`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019815`
原始查询	`SmilChr04G001094`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 70
产物	probable WRKY transcription factor 70
Arabidopsis	`AT3G56400` (WRKY70) WRKY DNA-binding protein 70 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824807] identity=41.9; qcov=0.683; evalue=2.64e-39; confidence=medium
Rice	`Os05g0322900` (WRKY45) - identity=37.6; qcov=0.66; evalue=5.77e-33; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019815

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804404.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057804404.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804404.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804404.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804404.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15654304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:15654404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B35
`Chr4:15654513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B6,B69,C67
`Chr4:15654557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:15655550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B83,C59
`Chr4:15655613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:15655646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:15655686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr4:15655743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B83,C59
`Chr4:15655763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,C27,C55
`Chr4:15655781`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A11,B1,B12,B137,B140,B32,B86,C23,C24,C25,C42,C83
`Chr4:15655803`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804404.1

262 aa

131

262

WRKY

PF03106 WRKY 122-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804404.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	122	182	8.2e-25	87.5	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948421.1
GTTTCGAAGATGAGAAAGTAGAGTAACCAAACTACTCAGAAAAAAATTGAGCATGGCATCTTCCTCCTGCGTTCACAGAAACGCCGTGCCGGAGCGAGTGATGACCGAGTTGACTCGCGGCCGGGAGATAGCCGACCGGATCCGGCTCATGCTGCGCGAGACCGGATTCGATGGCTCGGCCGGTTCAGTTTTTCCGGTTCAGAGCCTTGTGAGCCAGCTCCTGGACACCTTCACTCACTCTCTCGCCATGCTTCGCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019815
ATGGCATCTTCCTCCTGCGTTCACAGAAACGCCGTGCCGGAGCGAGTGATGACCGAGTTGACTCGCGGCCGGGAGATAGCCGACCGGATCCGGCTCATGCTGCGCGAGACCGGATTCGATGGCTCGGCCGGTTCAGTTTTTCCGGTTCAGAGCCTTGTGAGCCAGCTCCTGGACACCTTCACTCACTCTCTCGCCATGCTTCGCGACGGCGGCGAGTCGGATGAGGCTTCTCAGGCTCCTTCCGCCGCCAAATTGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804404.1
MASSSCVHRNAVPERVMTELTRGREIADRIRLMLRETGFDGSAGSVFPVQSLVSQLLDTFTHSLAMLRDGGESDEASQAPSAAKLEDSGDSCKTPAAKDRRGCYKRKRSSETRIKESSDLFEDGHAWRKYGQKSILNAKHPRNYYRCTHKFDQKCLATKQVQKIQDEPPLYRTTYNGQHTCNKSSLHHHVVPASPDSSSVMWSFNSIKQEEEIQMKTPDEYYISPHHFSPMSSDVYSCSHSIEDVDDIVGSFEDYFEFET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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