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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001152`

染色体: Chr04 坐标: 16982633-16985804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001152`
名称	SmilChr04G001152
描述	uncharacterized SmilChr04G001152
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	16982633 - 16985804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019853`
GeneID	`131019853`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019853`
原始查询	`SmilChr04G001152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835043]; symbol=AT5G49800; hit=AT5G49800; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835043]; symbol=AT5G49800; hit=AT5G49800; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G49800` (AT5G49800) Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835043] identity=68.6; qcov=0.843; evalue=1.34e-115; confidence=high
Rice	`Os11g0245500` - identity=60; qcov=0.875; evalue=3.35e-91; confidence=high
GO	GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF01852 (START)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019853

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804455.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057804455.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057804455.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804455.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804455.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:16982961`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A16,A4,B128,B83,C2,C30,C32,C59,C68,C9,D8,D9
`Chr4:16983267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:16983305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B1,B24
`Chr4:16983341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr4:16983346`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A18,B1,B24
`Chr4:16985559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804455.1

280 aa

140

280

START

PF01852 START 81-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804455.1`	Pfam	`PF01852`	START	Domain	81	257	6.3e-14	52.5	START domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948472.1
TAAATAAACTTCGTTCAAAATTGAAGGTTTTTAAAATAAAAACATAGTTAGAGACATTTAAAAAAAATACTGAAAATTGGGACACAAACTATAATTAACGGGATTAAAAATAATTAAGAAAGGGGGTGGGTTGGGGAAGATGGATGCACATGGACTGCTGTTGGCTTTTATTAGTGAGTGAAAATGGAGATAAAGACGTGCAGTTTTAATCATGGAGCTGCTTCTGGCATTCCATGTGCTTCTATCTTCTCGCCCCACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019853
ATGTGCTTCTATCTTCTCGCCCCACTTCACATTATTTTTCATAACACTAATATCTGTGTGTATATATTCACATATATTAGTGTGTGCATTAAAGGGAAACATCGGAAAATGCATAGCAACAGTCCTTCTTCCACTTGCAGCAGATCCTGGTCTATAAGCGAGGATTCGCTGCGGAGATACGTGTTCCACGCCAGTGAGAACTGCATACAAGAGTTGCTTTCTGCATCCGATTCCAACAAGCATGCCGACGCCGTGTCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804455.1
MCFYLLAPLHIIFHNTNICVYIFTYISVCIKGKHRKMHSNSPSSTCSRSWSISEDSLRRYVFHASENCIQELLSASDSNKHADAVSLDDGWKLVGVDANGVEISKRRSGSLHTFRSRWLLQSVQPHQFITVANAIHAAKEWDGDLVEGKYIKDLEENLSIVWLRYGERSKGLFRNREFIVYERRETMDDGTLVVAVASLPKEIAAGLQPKQNNSIRGLLLQSGWVVEKLQNDSCIVTYIAQLDPAGWLPKCFVNRLNTKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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