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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001224`

染色体: Chr04 坐标: 19098556-19103693 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001224`
名称	SmilChr04G001224
描述	probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19098556 - 19103693 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023694`
GeneID	`131023694`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023694`
原始查询	`SmilChr04G001224`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470
产物	probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470
Arabidopsis	`AT1G06470` (AT1G06470) Nucleotide/sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837159] identity=76.8; qcov=0.608; evalue=8.77e-70; confidence=high
Rice	`Os06g0153200` - identity=76.3; qcov=0.612; evalue=9.79e-70; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10539 (Dev_Cell_Death)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023694

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057809245.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057809245.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057809245.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057809245.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057809245.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19100301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:19100309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B118,B125,C17
`Chr4:19100317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A9,B102,B111,B12,B4,B55,B60,B77,B98,C20,C5,C72,D8
`Chr4:19100361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B46
`Chr4:19100375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B42,B43
`Chr4:19100375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr4:19100780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B33,B79,C36,C82
`Chr4:19100875`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr4:19100875`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr4:19102233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:19102289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B96,C19
`Chr4:19102294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B33,B79,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809245.1

227 aa

114

227

Dev_Cell_Death

PF10539 Dev_Cell_Death 136-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809245.1`	Pfam	`PF10539`	Dev_Cell_Death	Domain	136	220	1.5e-29	103.0	Development and cell death domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101480.1
CCGCCGCCGCGGCCGCCGAAGTTCCGGCGAGGAGCGCCGGCCTCGCCCACCTTATCTCTCATTCTTTTGACTCAATTTGGGCATTCACAAACTCACACCACCGCCCAATTTCTCAATCTCCGGTGAACGGCAGTGAGGCCGCCGCCACTCTCCCTCAAAATCTCACTTAAGCACCGCCTCAATCTGAAAAGGTTCCAGCCGCCACCACCGCCTGTATCTCAAGAGGCGGCGCCGCTCTCTCCTCTAAACCCTAGATCCCT...

XM_057953262.1
GTTCCGGCGAGGAGCGCCGGCCTCGCCCACCTTATCTCTCATTCTTTTGACTCAATTTGGGCATTCACAAACTCACACCACCGCCCAATTTCTCAATCTCCGGTGAACGGCAGTGAGGCCGCCGCCACTCTCCCTCAAAATCTCACTTAAGCACCGCCTCAATCTGAAAAGGTTCCAGCCGCCACCACCGCCTGTATCTCAAGAGGCGGCGCCGCTCTCTCCTCTAAACCCTAGATCCCTAATTCCTCCGTCTGAAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023694
ATGTCTGTCATTTATGTGGGGATACTATTAACAGTTGCAAGAGAGGCAGAATTTGAGTTTTGGGGTTTCATATTCGTTATGCTTGCTGCTGTCATGTCTGGGTTTCGGTGGACAATGACACAAATACTTCTCCAGAAAGAAACCTATGGTCTTAAAAATCCACTTACTTTGATGAGCTATGTGACCCCTATAATGGCAATTGCAACTGGTGTTCTTTCTTTGATGCTGGATCCATGGCACGAATTGAGAAAGAACGATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809245.1
MSVIYVGILLTVAREAEFEFWGFIFVMLAAVMSGFRWTMTQILLQKETYGLKNPLTLMSYVTPIMAIATGVLSLMLDPWHELRKNDYFNSSSHILRSSLLMLFGGTLAFFMVLTEYVLVSVTSAVTVTIAGVVKEAVTELLLFDFKSKLLYGVYEATSDGGLNLEPTAFGGKFPAQVKFKIFKECLPIPESSLRYVIKENYTGAKFKQELNVKQVNSLVLVHVQYCD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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