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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001364`

染色体: Chr04 坐标: 22158958-22159730 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001364`
名称	SmilChr04G001364
描述	vacuolar iron transporter homolog 4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22158958 - 22159730 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019410`
GeneID	`131019410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019410`
原始查询	`SmilChr04G001364`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar iron transporter homolog 4-like
产物	vacuolar iron transporter homolog 4-like
Arabidopsis	`AT3G43660` (AT3G43660) Vacuolar iron transporter (VIT) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823468] identity=61.3; qcov=0.957; evalue=4e-80; confidence=high
Rice	`Os04g0686800` - identity=57.7; qcov=0.875; evalue=2.34e-52; confidence=high
GO	GO:0005381 (iron ion transmembrane transporter activity); GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0006880 (GO:0006880); GO:0016020 (membrane); GO:0030026 (intracellular manganese ion homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF01988 (VIT1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057803937.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057803937.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057803937.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803937.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22159045`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr4:22159086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C18,C50
`Chr4:22159153`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A10,A18,A7,B11,B124,B131,B14,B46,C26,C4,C61
`Chr4:22159163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B59,B63,C85
`Chr4:22159298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:22159299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:22159300`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C10
`Chr4:22159300`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C10
`Chr4:22159322`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B53
`Chr4:22159322`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B53
`Chr4:22159366`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B35
`Chr4:22159366`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803937.1

208 aa

104

208

VIT1

PF01988 VIT1 36-103 aa PF01988 VIT1 95-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803937.1`	Pfam	`PF01988`	VIT1	Family	36	103	1.4e-34	120.5	VIT family
`XP_057803937.1`	Pfam	`PF01988`	VIT1	Family	95	198	1.4e-34	120.5	VIT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947954.1
ACAAACTAGCAATCAATTATTAACCATTTCTACTCGCAAATTAACTTAGCCTCAATTAATGGCTACCCCAAACCACCTCCACATTCTGTACCTAAGACAAAACGCGAGGACCAATCTCCCTCAAACGGAAGAAGAAATCGATTACGCCGGAAGGGCGCAGTGGCTCCGAGCCGCAGTGCTCGGAGCTGACGACGGCCTGCTCTCCGTCGCATCACTCATGATGGGAATAGGAGCCATTAGAGACGATGTCAAAGCCATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019410
ATGGCTACCCCAAACCACCTCCACATTCTGTACCTAAGACAAAACGCGAGGACCAATCTCCCTCAAACGGAAGAAGAAATCGATTACGCCGGAAGGGCGCAGTGGCTCCGAGCCGCAGTGCTCGGAGCTGACGACGGCCTGCTCTCCGTCGCATCACTCATGATGGGAATAGGAGCCATTAGAGACGATGTCAAAGCCATGATCCTCACCGGCTTTGCCGGACTCTTAGCCGGCGCGTGCAGCATGGCGGTCGGCGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803937.1
MATPNHLHILYLRQNARTNLPQTEEEIDYAGRAQWLRAAVLGADDGLLSVASLMMGIGAIRDDVKAMILTGFAGLLAGACSMAVGEFVSVYSQLDMEMKREKGMAENGERERERRPNPLQAAMASALAFSFGAILPLLAAAFITNHNVRLGVVVAAATLGLAASGGAGAALGGTKVVSSCGRVVVGGWMAMAITFGLTKLLGTSGLCI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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