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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001385`

染色体: Chr04 坐标: 22521444-22523065 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001385`
名称	SmilChr04G001385
描述	15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22521444 - 22523065 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019425`
GeneID	`131019425`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019425`
原始查询	`SmilChr04G001385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	15-cis-phytoene desaturase, chloroplastic/chromoplastic
产物	15-cis-phytoene desaturase%2C chloroplastic/chromoplastic
Arabidopsis	`AT3G09580` (AT3G09580) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820115] identity=62.3; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0626800` - identity=53.9; qcov=0.801; evalue=3.96e-137; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01593 (Amino_oxidase); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019425

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057803950.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057803950.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057803950.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057803950.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057803950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22521643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C61
`Chr4:22521649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C61
`Chr4:22521656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C61
`Chr4:22521661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C61
`Chr4:22521717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C61
`Chr4:22521764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B104,C61
`Chr4:22521808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:22521900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:22521958`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr4:22521958`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B26
`Chr4:22522031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,C18,C22,C44
`Chr4:22522250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803950.1

498 aa

249

498

FAD_binding_2

NAD_binding_8

Amino_oxidase

PF00890 FAD_binding_2 75-109 aa PF13450 NAD_binding_8 77-141 aa PF01593 Amino_oxidase 82-490 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803950.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	75	109	3.4e-05	24.0	FAD binding domain
`XP_057803950.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	77	141	2.6e-15	57.2	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057803950.1`	Pfam	`PF01593`	Amino_oxidase	Domain	82	490	9.4e-55	187.4	Flavin containing amine oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947967.1
CCTTTAAATCTAGAAATATAGAAAACATAAAACAAGAGACATATGTGGATATTGAAGAATGGAATACTGGATGACCATATCCTTATCCAAATCCAACTCACACGAAAAATGTCAGTCGCTGCCCTCTCCCTCCCGCTTTCTTCTTCCTCAACCCATTTCCCCTCTTCCAAATTCAAATCTCTCAGACCTCCCAACGCCACCCCATCGCAGATCTCCCCGCCCAACCCAGTCCCCTCTCCTCCCCAACCCTCCGACAACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019425
ATGTGGATATTGAAGAATGGAATACTGGATGACCATATCCTTATCCAAATCCAACTCACACGAAAAATGTCAGTCGCTGCCCTCTCCCTCCCGCTTTCTTCTTCCTCAACCCATTTCCCCTCTTCCAAATTCAAATCTCTCAGACCTCCCAACGCCACCCCATCGCAGATCTCCCCGCCCAACCCAGTCCCCTCTCCTCCCCAACCCTCCGACAACACCGGCGTCATCGTCGTCGGCGCTGGCCTCGCTGGCTTAGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803950.1
MWILKNGILDDHILIQIQLTRKMSVAALSLPLSSSSTHFPSSKFKSLRPPNATPSQISPPNPVPSPPQPSDNTGVIVVGAGLAGLAAATRLQAENIPFLLLEASDAVGGRVRTDFVDGFTLDRGFQIFITAYPEARKLLDYDALHLQQFYSGARVFFGGRFHTVADPRRHFPDSLQSLANPIGSPIDKFLIALTIIRVLSRSDFDILTADEVETIELLRSTGFSDSILDRFFRPFFGGIFFDRELETTSRLFDFVFKCLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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