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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001401`

染色体: Chr04 坐标: 22791704-22792840 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001401`
名称	SmilChr04G001401
描述	chlorophyll a-b binding protein CP24 10A, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22791704 - 22792840 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019439`
GeneID	`131019439`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019439`
原始查询	`SmilChr04G001401`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chlorophyll a-b binding protein CP24 10A, chloroplastic
产物	chlorophyll a-b binding protein CP24 10A%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G15820` (LHCB6) light harvesting complex photosystem II subunit 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838151] identity=78.8; qcov=1.01; evalue=2.06e-144; confidence=high
Rice	`Os04g0457000` (CP24) - identity=82.9; qcov=0.867; evalue=2.68e-135; confidence=high
GO	GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0009768 (photosynthesis, light harvesting in photosystem I); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00196 (Photosynthesis - antenna proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00504 (Chloroa_b-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019439

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057803969.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057803969.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057803969.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803969.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22791943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B108,D7
`Chr4:22791990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:22792016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C85
`Chr4:22792223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:22792251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:22792377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:22792409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr4:22792412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:22792706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803969.1

256 aa

128

256

Chloroa_b-bind

PF00504 Chloroa_b-bind 68-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803969.1`	Pfam	`PF00504`	Chloroa_b-bind	Family	68	244	3.9e-45	155.0	Chlorophyll A-B binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947986.1
AAGAAATCTATCCCTTGCATATCACCAATCCTACGTGGCACCCCACACGACTCATCTTTCGATTTCCTTCATAAGATATATCATGCAGCATTTGCCTTTTAAGTGCCATCTCATAGCTATTTTCCCCTTAGATTTTGGCAAAATCCAGATTCTTAGCAATCTATCTATACACAATAATTGAAAGAGGGGAGAAGAGATGGCTTCCACTTCTGCTGCATTGGTAAATGGCTTGGGATCTGCCTTCTTGACCGGTGGCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019439
ATGGCTTCCACTTCTGCTGCATTGGTAAATGGCTTGGGATCTGCCTTCTTGACCGGTGGCAAGAAGAGTCAGGCTCTTTTGTCCGCCCCCCTTGCCGCCAGGGCCGGTGGCGCCGCCGCCCCCAAGAGGCTCATCGTGGCGGCCGCCGCCCCAAAGAAGTCTTGGCTCCCCGGCGTCAGGGGCGGTGGCAACTTCATCGACCCCGAGTGGCTCGATGGCTCGCTCCCCGGCGACTACGGGTTCGACCCGCTCGGGCTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803969.1
MASTSAALVNGLGSAFLTGGKKSQALLSAPLAARAGGAAAPKRLIVAAAAPKKSWLPGVRGGGNFIDPEWLDGSLPGDYGFDPLGLGKDPAFLKWYREAELIHGRWAMAAVVGIFVGQAWSGIPWFEAGAAPGAVAPFSFGTLLGTQLLLMGWVESKRWVDFFNPESQSVEWATPWSRTAENFANATGEQGYPGGKFFDPLGVAGELKNGVYIPDEEKLDRLKLAEIKHARLAMVAMLIFYFEAGQGKTPLGALGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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