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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001568`

染色体: Chr04 坐标: 25989063-25993539 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001568`
名称	SmilChr04G001568
描述	uncharacterized SmilChr04G001568
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25989063 - 25993539 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023210`
GeneID	`131023210`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023210`
原始查询	`SmilChr04G001568`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OVP1; symbol=OVP1; hit=Os06g0644200; species=rice; confidence=weak
产物	OVP1; symbol=OVP1; hit=Os06g0644200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G15690` (AVP1) Inorganic H pyrophosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838138] identity=82.5; qcov=0.111; evalue=3.92e-15; confidence=weak
Rice	`Os06g0644200` (OVP1) - identity=85; qcov=0.111; evalue=1.95e-15; confidence=weak
GO	GO:0004427 (inorganic diphosphate phosphatase activity); GO:0009678 (diphosphate hydrolysis-driven proton transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF03030 (H_PPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023210

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057808735.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808735.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808735.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808735.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808735.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25989070`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A7,B102,B112
`Chr4:25989070`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A7,B102,B112
`Chr4:25989071`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A14,A15,A24,A6,B100,B113,B120,B16,B17,B26,B27,B31,B32,B33,B34,B51,B52,B6,B95,B96,B97,B98,C25,C4,C51,C56,C59,C66,C78,C8
`Chr4:25989082`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	35	A14,A15,A24,A6,A7,B100,B102,B112,B113,B120,B16,B17,B26,B27,B31,B32,B33,B34,B51,B52,B6,B67,B95,B96,B97,B98,C25,C4,C51,C56,C59,C66,C76,C78,C8
`Chr4:25989097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B7,C41
`Chr4:25990083`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr4:25990083`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr4:25990133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:25990167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C10
`Chr4:25990228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:25990252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C84
`Chr4:25990343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808735.1

361 aa

180

361

H_PPase

PF03030 H_PPase 211-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808735.1`	Pfam	`PF03030`	H_PPase	Family	211	250	2.5e-19	70.2	Inorganic H+ pyrophosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952752.1
ATGGGTAGACCATCAATGGTAGGTGGAAGACCTTCAGAAGCTGCAGGCGAAGATGACGCAGGTGGTGGACATGAGGTTGGGCCCGTCGCTGCCCACCCTCGCTGCTGTCCCGCGCCCACCCACCCTCGCTGCTGCCTCGCGCCCGCCCACCCTTGTCGCTGCATCGCACCGCTGCCGCCTCGGTGCTTTCCTCCTCCGCGCAGTCGCCACTCTGCCTGCCGCCTCGGCGCTTTCCCACGGCTCAAAAACCCTAGCCGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023210
ATGGGTAGACCATCAATGGTAGGTGGAAGACCTTCAGAAGCTGCAGGCGAAGATGACGCAGGTGGTGGACATGAGGTTGGGCCCGTCGCTGCCCACCCTCGCTGCTGTCCCGCGCCCACCCACCCTCGCTGCTGCCTCGCGCCCGCCCACCCTTGTCGCTGCATCGCACCGCTGCCGCCTCGGTGCTTTCCTCCTCCGCGCAGTCGCCACTCTGCCTGCCGCCTCGGCGCTTTCCCACGGCTCAAAAACCCTAGCCGTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808735.1
MGRPSMVGGRPSEAAGEDDAGGGHEVGPVAAHPRCCPAPTHPRCCLAPAHPCRCIAPLPPRCFPPPRSRHSACRLGAFPRLKNPSRRSACDGRFRRSACNRARRCAQPNLLCSSPCLSQSLSPPAFLCRPTVHVAPASSVRRLWRPLLQAPGDCASVDRPSTSFGLCLNWVTPQQKQLTTADEASGHGGRRNVLFNKKAAVFDRSRSFYLLCVFRRVGGGIYTKAADVRADLVGKVERNIPEDDPRNPVVRYLLCFLVDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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