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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001667`

染色体: Chr04 坐标: 27638315-27644091 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001667`
名称	SmilChr04G001667
描述	plastid division protein CDP1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	27638315 - 27644091 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019552`
GeneID	`131019552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019552`
原始查询	`SmilChr04G001667`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plastid division protein CDP1, chloroplastic
产物	plastid division protein CDP1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G19180` (PARC6) plastid division protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821452] identity=55.1; qcov=0.919; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0675800` (OsFbox238) - identity=48.2; qcov=0.861; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009706 (chloroplast inner membrane); GO:0010020 (chloroplast fission)
KEGG	-
Pfam	PF13355 (ARC6-like_IMS); PF23468 (ARC6); PF25515 (Arm_PDR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804101.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057804101.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057804101.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804101.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:27638800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:27638880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B84
`Chr4:27640579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:27640612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:27640620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B122,C37
`Chr4:27640697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:27642364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:27642615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:27642814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr4:27643085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B44,B76
`Chr4:27643202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B50,C7,C76,D1
`Chr4:27643238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804101.1

826 aa

413

826

Arm_PDR

ARC6

ARC6-like_IMS

PF25515 Arm_PDR 170-316 aa PF23468 ARC6 352-482 aa PF13355 ARC6-like_IMS 700-817 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804101.1`	Pfam	`PF25515`	Arm_PDR	Repeat	170	316	1.4e-48	165.4	Plastid division regulator ARM repeat
`XP_057804101.1`	Pfam	`PF23468`	ARC6	Repeat	352	482	6.8e-11	42.6	Plastid division regulator alpha solenoid domain
`XP_057804101.1`	Pfam	`PF13355`	ARC6-like_IMS	Domain	700	817	4.6e-29	102.1	ARC6-like, IMS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948118.1
TCACACAATTAACGGAGTTCATCCCTTCCTTGTTTGGAAGTTTTCCTTTTTGATAGAAAGGAATAAAAGAAAAGGAAAGAAATACTCCATGTAGCAAGGAAGGACCGTTTAGCAAAAAATCGAGACAAGTTAGGCTCCATAATCCGTCCTCAAATTCGCCAATGCAGATCAATTCCCACTCCAAAAACCCTTGCTAGAATTTTTTTTCTTCAACATTGAGAATCTATTTCAGAAATGTATGCAGACGACATGGAGCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019552
ATGGCCAATATTCACACGTTGGTGCCCAGTGTAAATAACATATACTTCTACAGTGAAACTGGAAACAAGTTCTGCTGTTACAATGCGGGCGATACTCTAACTTGGCGGCGGAACTACGACGCGAAGAAGAAATGCAGCGGTTGTGATTTTCACAGTGGCTGCGGAGCTAGGGATCCGGCGGTTGGCCGCTCATGGAGATTGTGTGCTGCCACGGACCTTCGTGTCGTTCAGGATAGTCCTAATAAAAGTATCAATGCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804101.1
MANIHTLVPSVNNIYFYSETGNKFCCYNAGDTLTWRRNYDAKKKCSGCDFHSGCGARDPAVGRSWRLCAATDLRVVQDSPNKSINAPNQVPLIEIPVTCYQLIGVHDQAEKDEIVKSVMHLKNAEIEEGYTKDAVLSRRDVLMDVRDKLLFEPEYAGNFKEKQPPKSSLKIPWTWLPGALCLLQEVGEEKLVLEIGRRALQHPESKPFVHDLLLSMALAECAIAKVGFEKNNISQGFEALARAQCLLRSKISLGKMMLLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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