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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001708`

染色体: Chr04 坐标: 28210366-28214226 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001708`
名称	SmilChr04G001708
描述	DNA polymerase epsilon subunit B
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28210366 - 28214226 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019592`
GeneID	`131019592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019592`
原始查询	`SmilChr04G001708`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA polymerase epsilon subunit B
产物	DNA polymerase epsilon subunit B
Arabidopsis	`AT5G22110` (DPB2) DNA polymerase epsilon subunit B2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832272] identity=66.9; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0160800` - identity=67.7; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006261 (DNA-templated DNA replication); GO:0008622 (epsilon DNA polymerase complex); GO:0042276 (error-prone translesion synthesis)
KEGG	smil03030 (DNA replication - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03410 (Base excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04042 (DNA_pol_E_B); PF29084 (OB_POLE2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804155.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057804155.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057804155.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804155.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804155.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28210878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B69
`Chr4:28212006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:28212027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:28212507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:28213583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:28213755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B98,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804155.1

530 aa

265

530

OB_POLE2

DNA_pol_E_B

PF29084 OB_POLE2 128-246 aa PF04042 DNA_pol_E_B 288-493 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804155.1`	Pfam	`PF29084`	OB_POLE2	Domain	128	246	3.4e-35	121.3	DNA polymerase epsilon subunit 2-like, OB-fold domain
`XP_057804155.1`	Pfam	`PF04042`	DNA_pol_E_B	Family	288	493	2.1e-47	162.0	DNA polymerase alpha/epsilon subunit B

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948172.1
TTTCCCGCCATTATCTACCTCTCCGAATCCAGCCGTAATCTCCTTCCTTTCCTCTCTGCCGCCAAAACCTCCACTTTTCACACACAACACACACTTCAAATCTGCATCCCAGAGAGCCGAAGCAGCGGCGAAGGAGATTGAACAATGAGCTCTAAGATGAGAAATAAAGTGCAGAAGAAGTTCAATATGAGGGGATACAAACTCAAAATGGAAGCCCTAACGGAAATCCTTGGTTTCATCAGTCGATTTCCCGAAGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019592
ATGAGCTCTAAGATGAGAAATAAAGTGCAGAAGAAGTTCAATATGAGGGGATACAAACTCAAAATGGAAGCCCTAACGGAAATCCTTGGTTTCATCAGTCGATTTCCCGAAGCGGAAGACGAAGCGCTCGATCTCCTCCTCGACGAGCTGCATAACGTTTCCTTGAAATCTTCGATACTGGATAAGGAGCCGGTGCAGAGAGTGGTGACTCTTTTGCTCGAAGCCGAGGCTGCAGTGGAGGAGAGTCCGACAACTAGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804155.1
MSSKMRNKVQKKFNMRGYKLKMEALTEILGFISRFPEAEDEALDLLLDELHNVSLKSSILDKEPVQRVVTLLLEAEAAVEESPTTSGHGSSASALRIIDAFDFPKFRYDAVKKLFHRYLGKLPIYGDASAKVTLYRDRFLLLFQRLSRDPHFSRPVFDSDMSDYGSCQISPIQSLVGQTGKRWVMGLISQLEDGHFYLEDLTAAVEVDLSNARITTGFFVENTIVLAEGEMLLDGIFQVKTCGFPPLEDREKSLSMLAGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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