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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001738`

染色体: Chr04 坐标: 28621910-28625969 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001738`
名称	SmilChr04G001738
描述	protein TIFY 6B-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28621910 - 28625969 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019618`
GeneID	`131019618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019618`
原始查询	`SmilChr04G001738`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmJAZ3` CORE-060; 2015	`KC864780`	`LOC131019618` `SmilChr04G001738` GeneID 131019618	nucleotide CDS and protein BLAST against active nuclear reference, 2026-09-27; identity 99.137%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIFY 6B-like
产物	protein TIFY 6B-like
Arabidopsis	`AT3G17860` (JAZ3) jasmonate-zim-domain protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821055] identity=36.7; qcov=0.997; evalue=6.34e-42; confidence=medium
Rice	`Os08g0428400` (OsJAZ9) - identity=29; qcov=1.12; evalue=3.23e-18; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009611 (response to wounding); GO:0031347 (regulation of defense response); GO:2000022 (regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06200 (tify); PF09425 (Jas_motif)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804193.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804193.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804193.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804193.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804193.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28622230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr4:28622240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B59
`Chr4:28623128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B58,B66,C2,C45
`Chr4:28623473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B47,B90,B92,C87
`Chr4:28623490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:28623679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:28623701`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C70
`Chr4:28623701`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C70
`Chr4:28624320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr4:28625541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804193.1

336 aa

168

336

tify

Jas_motif

PF06200 tify 158-189 aa PF09425 Jas_motif 280-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804193.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	158	189	4.6e-19	68.2	tify domain
`XP_057804193.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	280	304	1.2e-11	44.8	Jas motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948210.1
TACCACGAGAAGTGTTTAACATTAAAAAATTCAGAAAAACGTCACAATCATAAACCTGTATATGATACAGTTATTACATCTAATCTAATAAGCCTTCTACTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATAATATTTGAGTTCTTGTCTCCTCAAATATTCATTTTCTCTCTCATTCACGAGCAGCCAGCCATCATAGCTCAGCTCCAAACAAGCAGCCGTTTGTCTCCACTATTCACAACCAAATTTGGACCCTTTTCTTTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019618
ATGGAGAGAGATTTCATGGGTTTGTCTGTGAAGCAGGAGGTTCCTGATGAAATAATTGATGCTGCTTCAGTGAGAAGCTTACCAATGCAGTGGTCATTCTCCAACAAGGGCTCTGCTCTTCCTCAGCTCTTGTCTTTTCAAGGTGCTCAAGAAGACAAACAACCCAAAACTGGTTTTAATTCTCTTGCATCATCTGGATTGGTTACCTTAACTACCGATGTTTTCGACTCCGATCACAGCCAGTTTCCTGCTTCACAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804193.1
MERDFMGLSVKQEVPDEIIDAASVRSLPMQWSFSNKGSALPQLLSFQGAQEDKQPKTGFNSLASSGLVTLTTDVFDSDHSQFPASQKSHVPEKQGGVRYTVTTYGDTHNIRRAITTSPASYAAPVAGFPVANPLQAKPSNSAAVGTTDFRNSCKISNTPAQLTIFYNGSVCVYDDISPEKAQAIMLLAGNAHSVAPKATPPAVPVQAAMPRCSVPDRLTINQSYATTPRRSSPVPMTPISVSQCANKPSGARMSPPINAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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