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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001743`

染色体: Chr04 坐标: 28710995-28714189 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001743`
名称	SmilChr04G001743
描述	probable arabinose 5-phosphate isomerase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	28710995 - 28714189 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019635`
GeneID	`131019635`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019635`
原始查询	`SmilChr04G001743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable arabinose 5-phosphate isomerase
产物	probable arabinose 5-phosphate isomerase
Arabidopsis	`AT3G54690` (SETH3) Sugar isomerase (SIS) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824634] identity=76.2; qcov=0.945; evalue=1.13e-180; confidence=high
Rice	`Os02g0158300` (OsCBSSIS1) - identity=70.3; qcov=0.942; evalue=8.69e-169; confidence=high
GO	GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0016853 (isomerase activity); GO:0097367 (carbohydrate derivative binding); GO:1901135 (carbohydrate derivative metabolic process)
KEGG	smil00541 (Biosynthesis of various nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00571 (CBS); PF01380 (SIS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019635

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804208.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804208.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804208.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804208.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:28711455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:28711499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:28713744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804208.1

343 aa

172

343

SIS

CBS

PF01380 SIS 59-188 aa PF00571 CBS 218-274 aa PF00571 CBS 286-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804208.1`	Pfam	`PF01380`	SIS	Domain	59	188	5.2e-17	62.6	SIS domain
`XP_057804208.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	218	274	6.4e-16	59.1	CBS domain
`XP_057804208.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	286	341	6.4e-16	59.1	CBS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948225.1
TAGCAAGAATATGACGAGACAATCTTACTATAAATAGTACTTGCATCCGCACTAAGTTCTAATCATCTAAAAATATTGAGCGCGTTTTTTTCTTCCTTGAATCACAGATTCAGCTGCTCAGTCGAGCAAGAAATCCGGGAAAAATGGGGTCTCTTTCTCTCTCATTTACCGACCCACAAGATCAAGAAATGAACATGTCGCAGAAATTAGACAAAACCCATCTGCTCAACCTCTTCAAATGCCAGCAGAATTACCTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019635
ATGGGGTCTCTTTCTCTCTCATTTACCGACCCACAAGATCAAGAAATGAACATGTCGCAGAAATTAGACAAAACCCATCTGCTCAACCTCTTCAAATGCCAGCAGAATTACCTCAACCATTTCTTCCAGAATCTCGATCTCTCGCAAACCCTAGCATTCACGGAGACCCTCCTGAAGGCCGAGGGCACCATTTTCTTCTCCGGAGTCGGGAAATCGGGCTTCGTGGCGCAGAAGATCTCGCAGACGCTGGTGTCGCTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804208.1
MGSLSLSFTDPQDQEMNMSQKLDKTHLLNLFKCQQNYLNHFFQNLDLSQTLAFTETLLKAEGTIFFSGVGKSGFVAQKISQTLVSLGIKSGFLSPVDALHGDIGILSTTDLLVMFSKSGNSEELLKLVPCAKAKGVYLISVTSVTPNGLTRLCDLNVHLPLERELCPFDLAPVTSTAIQMVFGDTVAIALMGARNLSKDEYASNHPAGRIGKSLIFKVKDVMKKKDELPVCREQDLIMDLLVELTSKGCGCLLVINDDYH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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