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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001776`

染色体: Chr04 坐标: 29193652-29194937 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001776`
名称	SmilChr04G001776
描述	pto-interacting protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29193652 - 29194937 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023251`
GeneID	`131023251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023251`
原始查询	`SmilChr04G001776`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pto-interacting protein 1-like
产物	pto-interacting protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G48210` (AT1G48210) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841241] identity=49.8; qcov=1.07; evalue=6.54e-88; confidence=high
Rice	`Os05g0135800` (RLCK178) - identity=52.1; qcov=1.07; evalue=1.02e-87; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808776.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057808776.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808776.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808776.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808776.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29193661`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B33,C23
`Chr4:29193661`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B33,C23
`Chr4:29193738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B79,B95
`Chr4:29194026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B92,C87
`Chr4:29194031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:29194037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:29194057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B69,C83
`Chr4:29194233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B133,C17
`Chr4:29194235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:29194245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr4:29194252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B80
`Chr4:29194264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B69,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808776.1

286 aa

143

286

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 36-279 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 47-281 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808776.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	36	279	6.6e-29	101.8	Protein kinase domain
`XP_057808776.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	47	281	2.9e-39	135.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952793.1
ATGCAGCCAATTTCTGTTCCTGCAATACCAGTAGATGTTCTGAAGATTATTACTAATAATTTTAGTTCAAGGCGTTTGATCAAAGATGCAATTGGTGACAAAAGTGTTTATCATGCTATCCTGAGAAATGGAAAAGCTGCAGCAATAGAAAAGCTCTACAATTACCAGCCACACCAAGAATTTCTTCAGCAGGTTTCAATAGTATCTGACCTGAAGCATGAAAACGTGGTTGAGCTACTTGGTTACTGTGTGCACGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023251
ATGCAGCCAATTTCTGTTCCTGCAATACCAGTAGATGTTCTGAAGATTATTACTAATAATTTTAGTTCAAGGCGTTTGATCAAAGATGCAATTGGTGACAAAAGTGTTTATCATGCTATCCTGAGAAATGGAAAAGCTGCAGCAATAGAAAAGCTCTACAATTACCAGCCACACCAAGAATTTCTTCAGCAGGTTTCAATAGTATCTGACCTGAAGCATGAAAACGTGGTTGAGCTACTTGGTTACTGTGTGCACGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808776.1
MQPISVPAIPVDVLKIITNNFSSRRLIKDAIGDKSVYHAILRNGKAAAIEKLYNYQPHQEFLQQVSIVSDLKHENVVELLGYCVHDDLRFLAFEFSPLGSLYDILHSSSSGGQTLSWARRVKIAIGAAKGLEFIHRRGQIHCNIQSCNILLFDDNVAKIACFDLSIQRPNEEYYYYYHEALPFSVFLSRAYHSPECVLNGQFSSKTDVYSFGVVILELLTGRKPWDMQWLMAWAKHKDHVVATLKGNNFPTAAAKMAEVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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