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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002231`

染色体: Chr04 坐标: 36023044-36024024 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002231`
名称	SmilChr04G002231
描述	cyclin-dependent kinase G-2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36023044 - 36024024 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023371`
GeneID	`131023371`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023371`
原始查询	`SmilChr04G002231`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-dependent kinase G-2-like
产物	cyclin-dependent kinase G-2-like
Arabidopsis	`AT1G67580` (AT1G67580) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843079] identity=40.9; qcov=0.98; evalue=4.85e-58; confidence=medium
Rice	`Os04g0488000` (CDKG) - identity=42.6; qcov=0.98; evalue=1.68e-59; confidence=medium
GO	GO:0004693 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007346 (regulation of mitotic cell cycle)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023371

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808893.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808893.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808893.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057808893.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36023104`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B139,C22
`Chr4:36023104`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B139,C22
`Chr4:36023184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:36023214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B33
`Chr4:36023324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr4:36023360`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B63,B86,C53
`Chr4:36023360`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B63,B86,C53
`Chr4:36023458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:36023597`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr4:36023597`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C75
`Chr4:36023807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B46,B66,C31,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808893.1

304 aa

152

304

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 43-300 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 44-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808893.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	43	300	9.7e-60	202.9	Protein kinase domain
`XP_057808893.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	44	228	6.7e-27	95.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952910.1
CAGAAGCAATACACATTATTATTATTATTATTATTAGTTTGAGATTAATTTGAGCTCTCGAGTTCGATGATGGCGGAATTGGGGCTTCCCGAGAACCCCTTCTTGTTCGAGAAAGAAGATTGGGTTTACAAGGAGAAGACGGGTACCTTGTTGAAGAAAGAAGTTAGGGTTTACAAATCTTTATTCGATGAGTACGAGATTGAGAAGGAGATCAACCGGGGGGCCTTCGGCGTGGTGTACAGAGCGCGAGACAGGAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023371
ATGATGGCGGAATTGGGGCTTCCCGAGAACCCCTTCTTGTTCGAGAAAGAAGATTGGGTTTACAAGGAGAAGACGGGTACCTTGTTGAAGAAAGAAGTTAGGGTTTACAAATCTTTATTCGATGAGTACGAGATTGAGAAGGAGATCAACCGGGGGGCCTTCGGCGTGGTGTACAGAGCGCGAGACAGGAAAAGCAAGGAGACGGTGGCGATGAAGGAGGAGGTTGGCGGCGGAGGGCTACTGATGGAGATCGACATCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808893.1
MMAELGLPENPFLFEKEDWVYKEKTGTLLKKEVRVYKSLFDEYEIEKEINRGAFGVVYRARDRKSKETVAMKEEVGGGGLLMEIDILKSLPRHPNIVEFKKVARDGARVFVVMEYLEYDLQRVRAVMEQPFPLSITKTLMREILRGVAFLHHHGVVHRDLKPANILFGGANYDLKICDFGLSARLGSRCSAGAGTRWYKAPEVLGGCRSYTSAIDVWSVGCIMAEFVLDQPLFQGQSDAHQLACIREVLCGRTNLLRPLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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