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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002625`

染色体: Chr04 坐标: 41646222-41650354 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002625`
名称	SmilChr04G002625
描述	TGACG-sequence-specific DNA-binding protein TGA-1A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41646222 - 41650354 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021740`
GeneID	`131021740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021740`
原始查询	`SmilChr04G002625`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TGACG-sequence-specific DNA-binding protein TGA-1A-like
产物	TGACG-sequence-specific DNA-binding protein TGA-1A-like
Arabidopsis	`AT5G65210` (TGA1) bZIP transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836646] identity=65.8; qcov=1.02; evalue=8.06e-178; confidence=high
Rice	`Os04g0637000` (OsTGAP1) - identity=55; qcov=1.01; evalue=3.9e-137; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2); PF14144 (DOG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807003.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057807003.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807003.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807003.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807003.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41646514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:41646846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:41647249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:41647726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B49,C54
`Chr4:41648693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B35,C42
`Chr4:41648756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B59,C57,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807003.1

362 aa

181

362

bZIP_1

bZIP_2

DOG1

PF00170 bZIP_1 76-106 aa PF07716 bZIP_2 77-118 aa PF14144 DOG1 164-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807003.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	76	106	1.7e-09	38.4	bZIP transcription factor
`XP_057807003.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	77	118	6.2e-06	26.9	Basic region leucine zipper
`XP_057807003.1`	Pfam	`PF14144`	DOG1	Family	164	240	2.9e-27	95.3	Seed dormancy control

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951020.1
TGCTTGCTTGCTTGCTTGTTTCATTCTTAGTGGAAATCACACCAATTAAATTTTCATTCTCCAACTCTCCTTTCATTCATCTCACTGTAGCTCACGATAAACACACATACACACAACACACACTAACTACAAATTAGTATAATATCCTTTCACATTGTCTCCCCCACACTCACACTTGGACATATAATAATATACTCTATATGCCAGTATTGTCATAAGTCTTTTTCTTCTAATAGAATAGTTTATTTCCCATTTAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021740
ATGATGAATTCCACATCCACACAATTTGTTCCCTCAAGACGGATGGGCATATATGAGCCGATCCATCAGATGGGCATGTGGGGAGATTTCAAAGGTAACAATTGTCTGGATGCATCTCCACCGATGATTCTGGAGGTTGACCCTAAACTAGATAATCAGTCAGAGGATACTTCACATGGAACTGTTGGACCTTCAAATAAATACGACCAAGAAGCAAGTAAACCACCTGATAAGGTTTTAAGGCGTCTAGCACAGAACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807003.1
MMNSTSTQFVPSRRMGIYEPIHQMGMWGDFKGNNCLDASPPMILEVDPKLDNQSEDTSHGTVGPSNKYDQEASKPPDKVLRRLAQNREAARKSRLRKKAYVQQLESSKLRLIQLEQELGRARQQGLYSGSALDASPLGYAGSMNPGIATFELEYGHWVEEQDRQLSDLRNALHSSETGDVELRIFVDGGLAHYFDLFTMKAIAAKTDVFFLMSGMWKTSAERFFFWIGGFRPSELLKVLLPHLEPLSEQQRLDLGNLTQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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