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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002789`

染色体: Chr04 坐标: 43781852-43785186 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002789`
名称	SmilChr04G002789
描述	uncharacterized SmilChr04G002789
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43781852 - 43785186 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021884`
GeneID	`131021884`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021884`
原始查询	`SmilChr04G002789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833749]; symbol=AT5G37710; hit=AT5G37710; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833749]; symbol=AT5G37710; hit=AT5G37710; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G37710` (AT5G37710) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833749] identity=66.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0256300` - identity=59.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016042 (lipid catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3); PF03893 (Lipase3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021884

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057807193.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057807193.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057807193.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057807193.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807193.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43782013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:43782057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B122,B20
`Chr4:43782276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr4:43782346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:43782538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C17
`Chr4:43784483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:43784675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B26,C49
`Chr4:43784699`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B17,C11,C69
`Chr4:43784699`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B17,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807193.1

451 aa

226

451

Lipase3_N

Lipase_3

PF03893 Lipase3_N 8-67 aa PF01764 Lipase_3 96-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807193.1`	Pfam	`PF03893`	Lipase3_N	Domain	8	67	1.3e-14	54.6	Lipase 3 N-terminal region
`XP_057807193.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	96	232	1.8e-23	83.7	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951210.1
TAAACATAGCAGCAGGCACATTATTAACAGCTAGTCAACTCTATCTTGAAAAAAGCAGACTTAAATGGCATGGCAAGGCAAGCACAACCCATATTTTGGTTTATTCCTGATTCCGTGTCCGGGAAATGTCGGTTTCGTGCGGCGCTGAATGGGTGGTGGTGCTGGGGTGCATGCGGTGGGCGTGGAAGCGCTGCACCTACATCGGCTCCGACGACAGCGCCACGTGGGGCAGCGCCAGCGCAGACGAATTCGAGGCGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021884
ATGTCGGTTTCGTGCGGCGCTGAATGGGTGGTGGTGCTGGGGTGCATGCGGTGGGCGTGGAAGCGCTGCACCTACATCGGCTCCGACGACAGCGCCACGTGGGGCAGCGCCAGCGCAGACGAATTCGAGGCGATCCCCCGCGCGTGCCGCACAATCCTGGGCGTGTACGAGCCCGGCACCCAATGGGTGAAGCCGGAGTGGGTGGTGAAGCGCGCCAACTACGAGCAGACCCTGGGCAACGCTCCGCCCTACTTGATCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807193.1
MSVSCGAEWVVVLGCMRWAWKRCTYIGSDDSATWGSASADEFEAIPRACRTILGVYEPGTQWVKPEWVVKRANYEQTLGNAPPYLIYADHQNREIVLAIRGLNLANQSDYRVLLDNRLGMQMFDGGYVHNGLLKSAVWMLKRESETLRRLWEENGREYKMVFAGHSLGSGVAALLAVIVANHAHQLGGLPRTLLRCYAVAPARCMSLNLAVKYADIIHSLVLQDDFLPRTPTPLEDIFKSVFCLPCLLFFVCLRDTFIPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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