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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002916`

染色体: Chr04 坐标: 45352813-45359558 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002916`
名称	SmilChr04G002916
描述	protein SET DOMAIN GROUP 40
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45352813 - 45359558 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023730`
GeneID	`131023730`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023730`
原始查询	`SmilChr04G002916`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SET DOMAIN GROUP 40
产物	protein SET DOMAIN GROUP 40
Arabidopsis	`AT5G17240` (SDG40) SET domain group 40 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831588] identity=48.6; qcov=1.01; evalue=1.28e-165; confidence=high
Rice	`Os07g0471100` (OsSET26) - identity=45.3; qcov=0.988; evalue=6.61e-143; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0016279 (protein-lysine N-methyltransferase activity); GO:0018026 (peptidyl-lysine monomethylation)
KEGG	-
Pfam	PF00856 (SET); PF09273 (Rubis-subs-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023730

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809276.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809276.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809276.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809276.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809276.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45353239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr4:45353241`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A11,B2,B84,C57,C62,D2
`Chr4:45353326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C11,C69
`Chr4:45353427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:45357339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B126,B20
`Chr4:45357451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:45358386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B126,B20
`Chr4:45358502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:45359463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B24,B41,B44,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809276.1

489 aa

244

489

SET

Rubis-subs-bind

PF00856 SET 49-294 aa PF09273 Rubis-subs-bind 342-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809276.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	49	294	2.1e-05	25.6	SET domain
`XP_057809276.1`	Pfam	`PF09273`	Rubis-subs-bind	Domain	342	416	0.00012	23.5	Rubisco LSMT substrate-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953293.1
GATGTGCATTGCAGGTCGAGAATATTCTCTTTCAGAGAGACAATGGAGGGAGAAGAAGGAGCAAACCTAGCGAGATTTCTCAAATGGGCGACTGCGCTAGGAATCTCGGATTCTCCCAATTCCACCGGCGCTTCTTCCGCTTGTCTCGGCCTTTCTATGTGCCTTTCTCATTTTCCTGAAGCCGGCGGGAGAGGATTAGCTGCTACGCGCGCTTTAAAGAAAGGGGAATTGGTACTGAGGGTTCCCAATGAGGCGTTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023730
ATGGAGGGAGAAGAAGGAGCAAACCTAGCGAGATTTCTCAAATGGGCGACTGCGCTAGGAATCTCGGATTCTCCCAATTCCACCGGCGCTTCTTCCGCTTGTCTCGGCCTTTCTATGTGCCTTTCTCATTTTCCTGAAGCCGGCGGGAGAGGATTAGCTGCTACGCGCGCTTTAAAGAAAGGGGAATTGGTACTGAGGGTTCCCAATGAGGCGTTGATGACGAGCGATTGCCTGATTAGCAGTGATCAGAAGTTGGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809276.1
MEGEEGANLARFLKWATALGISDSPNSTGASSACLGLSMCLSHFPEAGGRGLAATRALKKGELVLRVPNEALMTSDCLISSDQKLANSLGKFHFLSPAQILCIALLNEVNKGRSSWWHPYLKQLPRSYDLLTSFSHFEIEALQIDDAIWTAEKAVHKGKMEWKLITPVLSELNFKPQFTTFNAWLWASATISSRTMHISWDTGGCLCPVGDFFNYAPPDEDPHQLGESEADDIDSFLHITSIDEGDKADKSTEELVDVKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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